دنیای میکروب ها
سال:1387 | دوره:1 | شماره:1 |تعداد مقالات:10

سابقه و هدف: امروزه استفاده از میکروارگانیسم ها برای حذف آلاینده های نفتی از محیط زیست بسیار مورد توجه دانشمندان قرار گرفته است. زیرا روش های یا از لحاظ اقتصادی مقرون به صرفه نمی باشد یا باعث به وجود آمدن ترکیبات سمی دیگری در محیط می شوند. هدف از این پژوهش، ارزیابی و تایید حذف زیستی نفت خام به وسیله باسیلوس ها می باشد.مواد و روش ها: در این پژوهش پانزده گونه باسیلوس تجزیه کننده نفت خام از مناطق آلوده به نفت جدا شد و شرایط بهینه رشدشان در محیط پایه نمکی واجد 1 تا 3% نفت خام مورد ارزیابی گردید. سپس با ارزیابی کشش سطحی و میزان کربن کل، نیتروژن و هیدروژن موجود در نفت خام در قبل و پس از تیمار با باکتری با روش ASTM D5291 اندازه گیری شد. همچنین سولفورزدایی زیستی با روش IP 242 مورد بررسی قرار گرفت.یافته ها: از گونه های مورد بررسی دو گونه که بهترین رشد در محیط پایه نمکی واجد نت داشتند، انتخاب گردیدند. اما بیشترین افزایش در چگالی نوری و شمارش سلول های زنده و کاهش pH میط کشت در روز پنجم از دوره آزمایش برای باسیلوس های S6 بدست آمد. زمان تجدید نسل بر روی محیط نمکی حاوی 1% نفت خام برای باسیلوس S6 و S35 به ترتیب 18 و 25 ساعت محاسبه شد. باسیلوس ها قادر به کاهش کشش سطحی محیط به ترتیب از 62 (mN/m) به 31 و 38 بودند که بیانگر آن است که این گونه ها قادر به تولید میزان قابل توجهی بیوسورفکتانت هستند. نتایج نشان داد که میزان کلی کربن از 85 (درصد جرمی) به 41 و 48 (درصد جرمی) به ترتیب برای باسیلوس S6 و S35 کاهش یافته است. همچنین مشخص شد که پس از گذشت یک ماه 42 درصد و 80 درصد از میزان کلی سولفور موجود در نفت به ترتیب توسط باسیلوس S6 و S35 حذف شده و مورد استفاده قرار گرفته است.نتیجه گیری: آنالیزهای آماری بر روی هیدروکربن های موجود در نفت دخام با استفاده از گاز کروماتوگرافی (C13-C30) نشان دهنده اثر تخریب زیستی باسیلوس ها بر روی هیدروکربن های نفتی و توانایی آن ها در استفاده از نفت به عنوان تنها منبع کربن و انرژی می باشد.

سابقه و هدف: انتروویروس ها یکی از مهم ترین ویروس های روده ای هستند که طیف وسیعی از بیماری ها را در انسان ایجاد می کند. اخیرا با توجه به زمان بر بودن و همچنین نیاز به انجام تست های تاییدی، استفاده از روش های مولکولی جهت تشخیص انتروویروس ها مورد توجه قرار گرفته است. هدف از این پژوهش ارزیابی روش های ICC-RT-PCR و کشت سلولی برای تشخیص انتروویروس های موجود در سیستم فاضلاب است.مواد و روش ها: در این پژوهش 63 نمونه فاضلاب با روش Grab sample تهیه و با روش های Pellet و Two-Phase تغلیظ و در رده های سلولی RD و HEp-2 کشت داده شد. در مرحله بعد، تمامی نمونه ها به کشت های سلولی حساس RD و HEp-2 تلقیح و پس از 24 ساعت گرمخانه گذاری در حرارت 36 درجه سانتی گراد، با استفاده از پرایمرهای Pan E.V،Pan P.V  و پرایمرهای اختصاصی Sabin بر روی نمونه های کشت سلولی تست  RT-PCR انجام شد.یافته ها: از مجموع نمونه های مورد بررسی، با استفاده از روش کشت سلولی از 33 نمونه انتروویروس (52.38 درصد) و توسط روش ICC-RT-PCR از 41 نمونه انتروویروس (65.07 درصد) و از 6 نمونه ویروس پولیو (9.52 درصد) جداسازی گردید.نتیجه گیری: با آنالیز آماری مشخص شد که بین روش های کشت سلولی و ICC-RT-PCR  ارتباط معنی داری در سطح 0.05 برای جداسازی انتروویروس ها وجود دارد. همچنین حساسیت روش ICC-RT-PCR برای تشخیص انتروویروس ها کمتر از 0.01، TCID50  ارزیابی شد که می تواند نشان دهنده قابل قبول بودن و حساسیت این روش برای تشخیص انتروویروس های موجود در فاضلاب باشد.

سابقه و هدف: استفاده کنندگان از مواد مخدر تزریقی، یک جمعیت مخفی هستند که غالبا به صورت غیرقانونی در جمعیت های پنهانی و گروه های پرخطر عضویت دارند و احتمال ابتلا به عفونت های ویروسی ناشی از تزریق مواد مخدر در این افراد بالا می باشد. در این مطالعه با توجه به این که از جمله گروه های پرخطر در معرض ابتلا به عفونت های ویروسی به ویژه آلودگی به ویروس هپاتیت نوع C افراد زندانی می باشد، بررسی سرواپیدمیولوژیک عفونت  HCV در زندانیان شهرستان شهرکرد مدنظر قرار گرفت. هدف از پژوهش بررسی شیوع HCV-Ab در زندانیان و معتادان تزریقی زندان شهرستان شهرکرد می باشد.مواد و روش ها: از کل زندانیان که 600 نفر می باشند نمونه سرم تهیه گردید و از طریق آزمون سرمی الیزا شیوع سرولوژیکی ویروس HCV ارزیابی شد. همچنین رابطه وجود HCV-Ab با فاکتورهای خطرساز از قبیل: جنسیت، تاهل، سابقه اعتیاد غیرتزریقی و تزریقی، سابقه قبلی زندانی شدن، سابقه خال کوبی، سابقه دریافت خون و یا فاکتورهای خونی، سابقه تماس جنسی مشکوک و سابقه آگاهی زندانیان با راه های انتقال هپاتیت نوع C، مورد ارزیابی قرار گرفت.یافته ها: پس از آنجام آزمون الیزا با استفاده از کیت الیزای HCV-Ab بر روی 600 نمونه سرم اخذ شده از زندانیان و معتادان تزریقی شهرستان شهرکرد 76 نمونه در آزمون الیزا واکنش سرمی مثبت نشان دادند که میزان آلودگی به HCV، 12.66% برآورد گردید. درصد میزان آلودگی به HCV، جنسیت، وضعیت تاهل، افراد معتاد غیرتزریقی و تزریقی، سابقه قبلی زندان، سابقه خال کوبی، سابقه حجامت، سابقه دریافت خون و یا فاکتورهای خونی، سابقه تماس جنسی مشکوک و میزان آگاهی از راه های انتقال HCV به ترتیب: 8.16%، 10.66%، 83/5%، 9.16%، 7.33%، 0.33%، 2.16%، 1.0%، 10.5% در بین زندانیان گزارش شد. اما بین آلودگی به HCV و جنسیت، تاهل، دریافت خون و یا فاکتورهای خونی، تماس جنسی مشکوک، آگاهی از راه انتقال HCV ارتباط معنی داری مشاهده نگردید. ولی بین آلودگی به HCV و اعتیاد، نوع اعتیاد، سابقه زندانی شدن، سابقه خال کوبی و گروه سنی ارتباط آماری معنی داری مشاهده گردید.نتیجه گیری: تایید نتایج وجود رابطه معنی دار میان وجود عفونت HCV با اعتیاد، نوع اعتیاد، سابقه زندانی شدن، سابقه خال کوبی و گروه سنی و عدم مشاهده رابطه آماری معنی دار با سایر فاکتورهای خطر ساز مورد مطالعه و همچنین شناسایی درصدهای متفاوتی از وجود HCV  در این افراد به انجام مطالعات تکمیلی در جمعیت های بزرگتر نیاز دارد.

سابقه و هدف: استرپتوکوک های دهانی، ارگانیسم های غالب در پلاک دندانی هستند و استرپتوکوکوس میوتانس، مهم ترین گونه در ایجاد پوسیدگی اولیه دندان است. لاکتوباسیل ها در مرحله بعدی پوسیدگی دندان دخالت دارند. هدف از این پژوهش، جداسازی باکتری های اسید لاکتیک موجود در دهان افراد در گروه های مختلف سنی، تعیین pH و بررسی اثر مهاری لاکتوباسیل ها بر روی تعدادی از باکتری های بیماریزای روده ای (سالمونلا، شیگلا و اشریشیا کلی) می باشد.مواد و روش ها: در این بررسی، نمونه برداری از بزاق و اطراف دندان 75 نفر در گروه های مختلف سنی توسط سواب انجام شد و در محیط MRS کشت داده شد. لاکتوباسیل ها و استرپتوکوک ها با روش استاندارد (شکل ظاهر کلنی، میکروسکوپی، تخمیر قندها و انجام تست های بیوشیمیایی) جداسازی و شناسایی شدند. همچنین pH مناسب رشد لاکتوباسیل ها و استرپتوکوک ها اندازه گیری گردید و اثر بازدارندگی لاکتوباسیل ها بر باکتری های بیماریزای روده ای (اشریشیا کلی، سالمونلا و شیگلا) با روش نقطه گذاری، دیسک گذاری و ایجاد چاهک تعیین شد.یافته ها: لاکتوباسیل های جدا شده شامل شش گونه، لاکتوباسیلوس فرمنتوم، لاکتوباسیلوس کازئی، لاکتوباسیلوس گاسری، لاکتوباسیلوس برویس، لاکتوباسیلوس پلانتاروم، لاکتوباسیلوس اسیدوفیلوس و استرپتوکوک جدا شده استرپتوکوکوس میوتانس بودند. لاکتوباسیل های جدا شده از دهان، رشد اشریشیا کلی را متوقف کردند، اما بر روی سالمونلا و شیگلا دارای اثر مهاری ضعیف یا فاقد اثر بازدارندگی بودند.نتیجه گیری: نتایج این بررسی نشان داد که برخی از لاکتوباسیل ها در شرایط آزمایشگاهی از رشد پاتوژن ها جلوگیری می کنند. بنابراین مصرف لبنیات در تغذیه روزانه به علت وجود لاکتوباسیل ها توصیه می شود.

سابقه و هدف: فلج شل حاد (Acute Flaccid Paralysis) توسط عوامل مختلفی ایجاد می شود که مهم ترین عامل آن پولیو ویروس می باشد. هدف از پژوهش ارزیابی عوامل غیر پولیویی ایجاد کننده فلج در ایران می باشد.مواد و روش ها: در این تحقیق به منظور بهبود در قدرت جداسازی انتروویروس های احتمالی موجود در مدفوع کودکان مبتلا به فلج شل حاد، تمام نمونه های مدفوع این کودکان، به پنج رده سلولی L20B، RD، Hep-2،Vero و GMK تلقیح شدند و با روش میکرونوترالیزاسیون مورد ارزیابی قرار گرفت.یافته ها: با تلقیح دو نمونه از هر یک از 458 مورد بیمار زیر 15 سال مبتلا به فلج شل حاد به پنج رده سلولی ذکر شده، در کل 34 مورد انتروویروس از گونه ها و سروتایپ های مختلف جداسازی گردید. 7.1% از کل موارد مبتلا به AFP از نظر کشت سلولی و جداسازی انتروویروس ها مثبت بودند. جنسیت نقش موثری در جداسازی انتروویروس ها نداشت. اکثر موارد جداسازی ویروس ها مربوط به گروه سنی 5-0 سال بود و با افزایش سن، از تعداد موارد جداسازی این ویروس کاسته شد. بیشترین ویروس های جدا شده مربوط به پولیوویروس ها (12مورد) و اکوویروس ها (12 مورد) بود. در این پژوهش نشان داده شد که موارد شناخته شده فلج باقیمانده (Residual Paralysis=RP) بیشتر توسط اکوویروس ها ایجاد می شوند. همچنین اختلاف معنی داری در تعداد موارد جداسازی پولیوویروس واکسن در افراد مبتلا به RP و افراد غیرمبتلا وجود نداشت. از این رو نشان داده شد واکسن های OPV مورد استفاده در کشور از ایمنی کافی برخوردار است. موارد جداسازی کوکساکی ویروس ها در نمونه های بالینی نیز بین افراد مبتلا به RP و افراد غیرمبتلا اختلاف معنی داری نداشت.نتیجه گیری: به دلیل معنی دار بودن اختلاف جداسازی انتروویروس های غیرپولیویی بین دو گروه دارای فلج باقیمانده مثبت و منفی، نقش این ویروس ها در ایجاد فلج باقیمانده ثابت می شود.

سابقه و هدف: جیوه یکی از سمی ترین فلزات سنگین می باشد. مقادیر اندک جیوه برای همه موجودات زنده سمی است. با این وجود برخی از باکتری ها با مکانیسم های خاص در برابر جیوه مقاوم هستند. هدف از این پژوهش جداسازی و شناسایی باکتری های مقاوم به جیوه و بررسی ارتباط بین میزان آلودگی محیط به جیوه و احتمال جداسازی باکتری های مقاوم است.مواد و روش ها: نمونه برداری از آب و رسوبات چهار ایستگاه در طول رودخانه کر و از تابستان 1385 تا بهار 1386 انجام گرفت. میزان جیوه در نمونه ها با روش بخار سرد و به وسیله دستگاه جذب اتمی اندازه گیری شد. تعداد باکتری ها در دو محیط کشت حاوی 10mg/l کلرید جیوه و بدون جیوه شمارش گردید. جداسازی باکتری های مقاوم از طریق غنی سازی اولیه و کشت مستقیم در محیط جامد حاوی 10mg/l کلرید جیوه صورت گرفت. باکتری ها به وسیله تست های متداول بیوشیمیایی شناسایی گردیدند.یافته ها: تعداد باکتری ها در محیط کشت بدون جیوه 1×107 CFU/mlو بیشتر از محیط فلزدار بود. فراوانی باکتری های مقاوم به جیوه در ایستگاه پل خان 54.2 و در ایستگاه درودزن 4.3 درصد شناسایی شد. این ایستگاه ها از نظر میزان آلاینده جیوه به ترتیب آلوده ترین و پاک ترین ایستگاه ها بودند. باکتری های Entrobacter sp.، Klebsiella sp.، E. coli،Serratia marcescens و Pseudomonas sp. به عنوان باکتری های مقاوم به جیوه جداسازی و شناسایی گردید.نتیجه گیری: نتایج این پژوهش نشان داد که استفاده از روش غنی سازی اولیه در مقایسه با روش کشت مستقیم، موجب جداسازی بهتر باکتری های مقاوم می شود. علاوه بر این افزایش میزان جیوه در محیط، احتمال جداسازی باکتری های مقاوم به جیوه را افزایش می دهد.

سابقه و هدف: امروزه رنگدانه های زیستی (Biopigments) در تهیه و تولید محصولات دارویی به وفور مورد استفاده قرار می گیرند. یکی از مهم ترین آن ها رنگدانه قرمز تری پیرولی سراشیا مارسسنس است که Prodigiosin نامیده می شود. در این تحقی افزایش توان تولید این رنگدانه توسط باکتری مزبور با استفاده از محیط های کشت مختلف مورد ارزیابی قرار گرفت.مواد و روش ها: در این بررسی، از سویه سراشیا مارسسنس PTCC1111 استفاده شد. سپس توان تولید رنگدانه پرودی جیوسین بر روی محیط های کشت Nutrient broth، Sesame seed broth، Tripticase soya broth،Brain heart infusion broth و Peanut seed broth در دماهای 24، 28، 30 و 37 درجه سانتی گراد با روش اسپکتروفتومتری ماورای بنفش در طول موج 535 نانومتر بررسی شد. به منظور خالص سازی رنگدانه پرودی جیوسین، پس از کشت باکتری مزبور در محیط های Seame seed broth و Peanut seed broth مراحل متوالی سانتریفوژ از نمونه رشد کرده در rpm10000 انجام گرفت. سپس با استفاده از حلال های آلی اتیل استات، استون، سدیم سولفات، دی کرومتان، کلروفورم رنگدانه استخراج شد و در نهایت با روش کروماتوگرافی ستونی خالص سازی رنگدانه صورت گرفت.یافته ها: نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که بهترین محیط کشت برای بیشترین میزان تولید این رنگدانه، محیط کشت Peanut seed broth و Seame seed broth و دمای 28 درجه سانتی گراد می باشد. باکتری مورد نظر در محیط های یاد شده حتی در دمای 37 درجه سانتی گراد نیز قادر به تولید رنگدانه بود. خالص سازی رنگدانه با استفاده از اسپکتروفتومتری ماوای بنفش در طول موج 535 نانومتر تنها یک قله (پیک) را نشان داد.نتیجه گیری: با توجه به اهمیت کاربردی رنگدانه های زیستی، بهینه سازی شرایط تولید آن ها در حد بالاتر پیشنهاد می شود.

سابقه و هدف: امروزه یکی از موضوعات مهم بهداشتی، انتقال بیماری های عفونی مانند هپاتیت نوع B به ویژه آلودگی های منتقله از طریق خون در افراد با رفتارهای پرخطر در جامعه می باشد. ازجمله این افراد در معرض ابتلا به هپاتیت B، زندانیان و معتادان تزریقی استفاده کننده از سرنگ های مشترک می باشند. بنابراین در این تحقیق بررسی شیوع سرولوژیکی عفونت ویروس هپاتیت نوع B در زندانیان زندان شهرستان شهرکرد و رابطه آن با فاکتورهای خطرساز به منظور تعیین جایگاه عفونت این ویروس مدنظر قرار گرفت.مواد و روش ها: در این مطالعه که به صورت گذشته نگر انجام گرفت از کل زندانیان زندان شهرکرد که 600 نفر و همگی مرد بودند نمونه سرم تهیه گردید و امکان وجود HBsAg در این نمونه ها با آزمایش الایزا ارزیابی گردید. همچنین رابطه وجود HBsAg با فاکتورهای خطرساز ازقبیل جنسیت، تاهل، سابقه اعتیاد غیرتزریقی و تزریقی، سابقه قبلی زندانی شدن، سابقه خال کوبی، سابقه دریافت خون و یا فاکتورهای خونی، سابقه تماس جنسی مشکوک و سابقه آگاهی زندانیان با راه های انتقال هپاتیت نوع B مورد بررسی قرار گرفت.یافته ها: تعداد 90 نفر از کل افراد مورد بررسی (15%) آلوده به آنتی ژن سطحی ویروس HBV بودند. همچنین درصد وجود HBsAg در مردان، در افراد متاهل، در افراد معتاد، در معتادان تزریقی، در افراد دارای سابقه زندان، در زندانیانی که سابقه خال کوبی داشتند، در زندانیان دارای سابقه دریافت خون و یا فاکتورهای خونی، در زندانیان دارای سابقه تماس جنسی مشکوک و در زندانیانی که از راه های انتقال هپاتیت نوع B آگاهی داشتند به ترتیب 14.66%، 9.5%، 7.34%، 3.17%، 4.66%، 4.0%، 1.16%، 1% و 8.66% گزارش گردید. همچنین بین آلودگی به هپاتیت نوع B، سابقه اعتیاد، نوع اعتیاد، سابقه زندانی شدن، تماس جنسی مشکوک و آگاهی از راه انتقال این بیماری ارتباط آماری معنی داری مشاهده نگردید. اما بین آلودگی به هپاتیت نوع B و سابقه دریافت خون و یا فاکتورهای خونی ارتباط آماری معنی داری وجود داشت.نتیجه گیری: وجود رابطه معنی دار میان وجود عفونت HBV با سابقه خال کوبی و سابقه دریافت خون و یا فاکتورهای خونی و عدم مشاهده روابط آماری معنی دار با سایر فاکتورهای خطرساز مورد مطالعه و همچنین شناسایی درصدهای متفاوتی از وجود HBsAg در این افراد نیاز به مطالعات تکمیلی در جمعیت های بزرگتر را یادآوری می نماید.