در بسیاری از مناطق آبیاری، سطح ایستابی کم عمق باعث ایجاد مشکلات ماندابی و شوری می شود که برای کنترل این وضعیت، از سامانه زهکش های زیرزمینی استفاده می گردد. در اکثر مواقع این زهکش ها مقدار زیادی از آب و نمک را به محیط تخلیه می کنند که برای جلوگیری از این حالت، لازم است زه آب ها را مدیریت کرد. پژوهش حاضر روی یک مدل فیزیکی و برای فاصله های 4/1، 1 و 6/0 متر و عمق های 4/0، 3/0 و 2/0 متری لوله های زهکشی انجام گرفت. اندازه گیری از دبی خروجی، شوری زه آب، شوری آب زیرزمینی و تراز سطح ایستابی نسبت به زمان انجام شد. سپس با استفاده از روش تحلیل پویایی سیستم که یک روش شبیه سازی به صورت شی گرا و مبتنی بر روابط بازخورد است، کیفیت و کمیت زه آب خروجی، کیفیت آب زیرزمینی و تراز سطح ایستابی نسبت به زمان شبیه سازی شد. اطلاعات حاصل از شبیه سازی با مقادیر اندازه گیری شده مقایسه شد و ضریب همبستگی برای دبی خروجی، شوری زه آب، تراز سطح ایستابی و شوری آب زیرزمینی حالت آزمایشی (فاصله زهکش ها: 4/1 متر و عمق: 4/0 متر) به ترتیب 75/0، 92/0، 98/0 و 97/0 به دست آمد. همچنین مقادیر شاخص آماری RMSE برای پارامترهای فوق به ترتیب برابر با 1875/0 میلی متر بر دقیقه، 1684/0 دسی زیمنس بر متر، 0081/0 متر و 0825/0 دسی زیمنس بر متر به دست آمد که این امر نشان می دهد نتایج شبیه سازی از دقت بالایی برخوردارند. بررسی تجمعی کمیت و کیفیت زه آب خروجی از زهکش ها نشان داد که با افزایش عمق و فاصله زهکش ها، حجم و مقدار نمک خروجی افزایش می یابد.