هندسه مقاطع رودخانه در تمامی مدل های شبیه سازی هیدرولیک رودخانه اهمیت اساسی دارد، برداشت داده های آن ملزم به انجام عملیات سخت و هزینه بر نقشه برداری است. هدف از تحقیق حاضر شناسایی روابط هیدرولیکی مساحت سطح مقطع، پیرامون مرطوب و عرض آزاد سطح آب، مستخرج از مقاطع با استفاده از روش مسئله معکوس است. این تحقیق با در نظر گرفتن رودخانه غیرمنشوری و مقاطع نامنظم، ابتدا بازه رودخانه مورد شناسایی را با توجه به تعداد ایستگاه های مشاهداتی، به چند زیربازه تقسیم کرده و سپس روابط مذکور را برای هر زیربازه به طور جداگانه مورد شناسایی قرار می دهد. مدل یک بعدی حاکم بر رفتار جریان غیردائمی در رودخانه، معادله های سنت-ونانت می باشند، که برای نیل به هدف این مقاله، بایستی به روش معکوس حل شوند. برای حل این مسئله به داده های اندازه گیریشده تراز سطح آب، در چندین مکان و زمان، به عنوان ورودی به مدل معکوس نیاز است. صحت سنجی مدل ارائه شده، با استفاده از دو مثال فرضی و واقعی، به منظور مقایسه روابط هیدرولیکی شناسایی شده و میانگین روابط هیدرولیکی حاصل از داده های واقعی مقاطع، انجام شد. نتایج حاصل از ارزیابی و شاخص های آماری مربوطه توانایی بالای مدل پیشنهادی را تأیید می کند.