امروزه بات نت ها به عنوان یک ناهنجاری در فرآیند تبادل اطلاعات و آسیب رساندن به منابع شبکه تبدیل شده اند. روش های تشخیص آن ها همواره با چالش هایی روبرو بوده است و به عنوان یک موضوع تحقیق مورد بررسی و به روز شدن قرار گرفته است. اصلی ترین جزء یک بات نت، کانال فرمان و کنترل آن است و مدیربات توسط این کانال، فرمان های خود را برای اجرا روی سیستم قربانی ارسال می کند. در صورت تشخیص کانال فرمان و کنترل یک بات نت، عملا ارتباط با مدیر بات برقرار نشده و دستورات مدیربات اجرا نمی شوند. به همین دلیل مدیر بات با استفاده از انواع روش های فرار سعی می کند احتمال کشف کانال را پایین نگه دارد. کانال پنهان فرمان و کنترل مفهومی است که بات نت های نسل جدید برای مخفی سازی ارتباط خود به کار می برند. در این مقاله یک مدل انتزاعی از بات نت پیشنهاد شده است که در آن فرمان های مدیر بات، مبتنی بر تاخیر زمانی بین بسته های و توالی آن ها ارسال می شوند. این فرمان ها از طریق کانال فرمان و کنترل پنهان زمانی ارسال می شوند. در ادامه با استفاده از مفهوم فعالیت گروهی بات ها؛ روشی برای تشخیص این بات نت پیشنهاد شده است. معماری روش تشخیص، از سه لایه جمع آوری و پردازش ترافیک، پردازش الگوها و تشخیص دومرحله ای تشکیل شده است. با استفاده از روش تشخیص دو مرحله ای که شامل ماتریس شباهت و آنتروپی است، میزبان های آلوده به بات تشخیص داده می شوند. برای ارزیابی روش، پنج کانال زمانی معتبر شبیه سازی شده و هر کدام برای ارسال فرمان های مدیربات مورد استفاده قرار می گیرند. نتایج آزمایش ها، کارایی روش تشخیص با وجود حداقل دو بات در شبکه را نشان می دهد.