ریحان(Ocimum basilicum L. ) حاوی مقادیر بالایی از ترکیبات فنلی و ترکیبات فعال زیستی با نقش آنتی اکسیدانی است. سیستم کشت ریشه مویین˓ روشی مناسب برای تولید ترکیبات ثانویه دارویی می باشد. جهت بررسی توانایی سویه های باکتری Agrobacterium rhizogenes در القای ریشه مویین و تولید متابولیت های ثانویه˓ گیاهچه های ریحان در محیط کشت MS2/1 کشت شدند. پس از 45 روز˓ ریزنمونه های برگ˓ ساقه و نواحی گره توسط چهار سویه باکتری (ATCC-15834, A4, MSU, R1000) تلقیح شدند و ریشه مویین را در زمان های متفاوت القاء کردند. پس از 14 روز˓ ریشه های مویین تنها در نواحی گره ظاهر شدند ولی ریزنمونه های برگ و ساقه پاسخی به تلقیح نشان ندادند. ریشه های تولید شده به محیط MS مایع منتقل شدند و پس از 60 روز˓ ویژگی های رشد و میزان فنل کل بررسی گردید. DNA ژنومی از ریشه های مویین و غیرمویین استخراج و ماهیت القای ریشه های مویین با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن rol C در واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) تایید شد. درصد القای ریشه مویین به طور معنی داری تحت تاثیر سویه باکتری قرار داشت. بالاترین درصد القای ریشه (1/68 درصد)˓ بیشترین تعداد ریشه مویین در هر ریزنمونه (8/4 عدد) و بیشترین طول ریشه (8/1 سانتی متر) به سویه ATCC-15834 تعلق داشت. بالاترین وزن خشک (2/103 میلی گرم) و میزان فنل کل (312 میلی گرم گالیک اسید بر گرم ماده خشک) به همین سویه مربوط بود که افزایش 6/4 برابری نسبت به شاهد غیرمویین داشت. نتایج این مطالعه نشان داد که سویه ATCC-15834 را می توان به عنوان یک سویه موثر در القا و رشد ریشه های مویین و نیز تولید متابولیت ثانویه در ریحان معرفی کرد.