ریزجلبک ها از منابع ارزشمند متابولیت های ثانویه با فعالیت های زیستی متنوع هستند. از بین ترکیبات زیست فعال مختلف، آلکالوئیدها به دلیل داشتن خواص دارویی منحصربه فرد توجه زیادی را به خود جلب کرده اند. روش های مختلفی جهت بررسی حضور آلکالوئید در منابع طبیعی وجود دارد. هدف از این مطالعه، مقایسه حساسیت روش های مایر و واگنر با روش بروموکروزول گرین جهت ردیابی اولیه آلکالوئیدها در ریزجلبک ها بود. برای این منظور، عصاره متانولی اسپیرولینا پلاتنسیس به عنوان مدل ریزجلبکی تهیه گردید. با استفاده از دو روش استاندارد (مایر و واگنر) و روش رنگ سنجی بروموکروزول گرین، حضور آلکالوئیدها در این ریزجلبک بررسی شد. سپس کروماتوگرافی لایه نازک برای تأیید حضور آلکالوئیدها اجرا شد. محتوای آلکالوئید کل نیز با استفاده از روش تیتراسیون اسید-باز اندازه گیری شد. نتیجه ی ارزیابی عصاره متانولی اسپیرولینا پلاتنسیس برای حضور آلکالوئیدها توسط معرف های استاندارد، منفی بود؛ اما روش بروموکروزول گرین و کروماتوگرافی لایه نازک حضور آلکالوئید در ریزجلبک را نشان داد. میزان آلکالوئید کل به دست آمده از روش تیتراسیون اسید-باز، 4/11 میلی گرم به ازای هر گرم وزن خشک ریز جلبک محاسبه شد که در مقایسه با مقدار به دست آمده از روش بروموکروزول گرین در سطح 05/0 P< تفاوت معنی داری وجود نداشت. درمجموع این مطالعه نشان داد که روش بروموکروزول گرین به دلیل سادگی، عدم نیاز به تجهیزات گران قیمت و به خصوص حساسیت بالا، روش بهتری برای تعیین حضور آلکالوئیدها در زیست توده ریز جلبک ها است.