مقدمه: مشاهده عوارض ترومبوآمبولیک در عروق شریانی وریدی در سندرم آنتی فسفولیپید موجب شد که تحقیق جهت علت ایجاد ترومبوز داخل عروقی در این سندرم مورد بررسی قرار گیرد تا معلوم گردد که آیا علت ایجاد ترومبوز همانند ترومبوز داخل عروق کرونر قلب عفونی است یا مکانیسم دیگری در تشکیل ترومبوز دخالت دارد. هدف از انجام این تحقیق، این بود که چنانچه ثابت شود عوامل ایجاد کننده ترومبوز داخل عروقی، عفونی و التهابی است اقدامات پیشگیرانه و درمانی مناسبی در نظر گرفته شود.روش کار: در این مطالعه مورد ـ شاهد، توصیفی 30 بیمار (25 زن و 5 مرد) با تشخیص قطعی ابتلا به سندرم آنتی فسفولیپید بعنوان گروه مورد و 45 نفر فرد سالم بعنوان گروه کنترل در نظر گرفته شدند و تعیین آنتی بادی جهت دو مورد هلیکوباکترپیلوری و سیتومگالوویروس به روش الیزا بعمل آمد. نتایج: آزمایش هلیکوباکترپیلوری در 13 مورد یعنی 3/43 درصد از 30 بیمار گروه مورد، مثبت بود. در حالیکه در گروه شاهد موارد مثبت 7/66 درصد بود (P<0.05). از 30 مورد آزمایش سیتومگالوویروس، فقط 15 مورد (50 درصد) نتیجه آزمون آزمایش مثبت بود در حالیکه در گروه شاهد در 33 نفر (3/73%) نتیجه آزمایش مثبت بوده است (P<0.05).بحث: نتایج این مطالعه نشان می دهد که در موارد مبتلا به سندرم آنتی فسفولیپید، سطح تولید آنتی بادی جهت هلیکوباکترپیلوری و سیتومگالوویروس کمتر از افراد سالم است و رابطه منفی بین این ارگانیسم ها و ترومبوز عروقی سندرم آنتی فسفولیپید وجود دارد.