زمینه و هدف: مالاریا در جنوب شرقی کشور از جمله شهرستان جیرفت به صورت اندمیک وجود دارد و در صورت مناسب شدن شرایط اپیدمیولوژیک می تواند بهداشت مردم منطقه را تهدید نماید. آنوفل فلوویاتیلیس یک گونه کمپلکس و یکی از مهمترین ناقلین مالاریا در ایران می باشد. این کمپلکس دارای سه گونه S ,T ,U و 7 ژنوتایپS ،U ، T1، T2،Y ،X و V می باشد که در بیولوژی، اکولوژی و قدرت انتقال بیماری با هم کاملا متفاوت می باشند. بنابراین برنامه ریزی کنترل ناقلین بر اساس نوع گونه می تواند متفاوت باشد. هدف این مطالعه تعیین گونه های فلوویاتیلیس کمپلکس در منطقه مالاریاخیز جیرفت به کمک آنالیز توالی بخش های D3 و ITS2 ژن rDNA می باشد.مواد و روش کار: نمونه های فلوویاتیلیس با استفاده از روش های صید کلی، شلتر پیت و گزش شبانه انسانی و حیوانی صید شدند. آزمایشات PCR دو بخش D3 و ITS2 روی DNA نمونه ها انجام شد و سپس محصولات PCR تعیین توالی شدند. توالی های به دست آمده به کمک مقایسه با نمونه های موجود در بانک جهانی ژن و درخت های فیلوژنی در سطح گونه و ژنوتایپ مورد شناسایی قرار گرفتند.یافته ها: لوکوس های D3 به طول 376bp و ITS2 به طول 514bp به کمک PCR تکثیر شدند و توالی آن ها مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج بررسی ها نشان داد که نمونه های فلوویاتیلیس شهرستان جیرفت مشابه ژنوتایپ های T2 و Y گونه T کمپلکس آنوفلس فلوویاتیلیس می باشند.نتیجه گیری: گونه T تنها گونه شناخته شده کمپلکس فلوویاتیلیس در جیرفت می باشد و بر اساس شواهد مطالعات قبلی می تواند ناقل مالاریا در منطقه باشد.