مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

1,120
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

854
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

خوشه بندی داده های بیان ژنی توسط عدم تشابه جنگل تصادفی

صفحات

 صفحه شروع 109 | صفحه پایان 118

چکیده

 زمینه و هدف: خوشه بندی داده های بیان ژنی در تشخیص و درمان سرطان, دارای اهمیت بسزایی است. مشخصه ی بارز این داده ها تعداد زیاد متغیرها (ژن ها) نسبت به تعداد داده ها (بیماران) است. بسیاری از روش های خوشه بندی بر پایه ی عدم تشابه داده ها که حاصل محاسبه ی یک تابع فاصله است, بنا شده اند و افزایش بعد, کارآیی توابع فاصله را کاهش می دهد. در این تحقیق معیاری جدید برای محاسبه ی عدم تشابه در ابعاد بالا, بر اساس یک روش رده بندی به نام جنگل تصادفی معرفی شده و کارایی آن در تحلیل داده های بیان ژنی, مورد ارزیابی قرار گرفته است.روش کار: در این مقاله خوشه بندی مجموعه داده ی چاودری و همکاران توسط عدم تشابه جنگل تصادفی مد نظر قرار گرفته است. بدین منظور ابتدا مساله ی خوشه بندی به مساله ی رده بندی تبدیل شده و با انجام رده بندی جنگل تصادفی, عدم تشابه مربوطه محاسبه شده است. سر انجام داده ها توسط روش خوشه بندی افراز حول مدوید, خوشه بندی شده و نتیجه ی خوشه بندی توسط شاخص رند تعدیل یافته مورد ارزیابی قرار گرفته است. تمامی تحلیل ها با نرم افزار R انجام شده است.یافته ها: مقدار شاخص رند تعدیل یافته (8149.0), نشان دهنده ی انطباق مطلوب خوشه های تخمینی با گروه های واقعی است. همچنین با استفاده از قابلیت تعیین اهمیت متغیرها در روش جنگل تصادفی, ژن شماره ی 31 موثرترین ژن در این خوشه بندی شناخته شد و توانستیم خوشه های تخمینی را تنها بوسیله ی این ژن توصیف کنیم.نتیجه گیری: عدم تشابه جنگل تصادفی, معیاری کارا برای سنجش عدم تشابه داده ها در خوشه بندی داده های بیان ژنی است. همچنین می توان با استفاده از قابلیت منحصر به فرد این روش, ژن های موثر در خوشه بندی را شناسایی نموده و خوشه های تخمینی را به وسیله ی آن ها توصیف نمود.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    فرهادی، زهره، و شاهسونی، داوود. (1394). خوشه بندی داده های بیان ژنی توسط عدم تشابه جنگل تصادفی. علوم پزشکی رازی (مجله دانشگاه علوم پزشکی ایران)، 22(136)، 109-118. SID. https://sid.ir/paper/10872/fa

    Vancouver: کپی

    فرهادی زهره، شاهسونی داوود. خوشه بندی داده های بیان ژنی توسط عدم تشابه جنگل تصادفی. علوم پزشکی رازی (مجله دانشگاه علوم پزشکی ایران)[Internet]. 1394؛22(136):109-118. Available from: https://sid.ir/paper/10872/fa

    IEEE: کپی

    زهره فرهادی، و داوود شاهسونی، “خوشه بندی داده های بیان ژنی توسط عدم تشابه جنگل تصادفی،” علوم پزشکی رازی (مجله دانشگاه علوم پزشکی ایران)، vol. 22، no. 136، pp. 109–118، 1394، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/10872/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button