مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

1,062
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

0
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

یافتن ژن در ژنوم های پروکاریوتی با استفاده از مدل مخفی مارکوف

صفحات

 صفحه شروع 47 | صفحه پایان 54

چکیده

 در این تحقیق, یک سامانه کاملا اتوماتیک Gene finder که به صورت خودآموز عمل می کند, معرفی می شود. این سامانه که خواص آماری ژن ها را تخمین می زند, بر اساس الگوریتم (Hidden Markov Model) HMM, به صورت اتوماتیک محل دقیق ژن ها را در ژنوم های پروکاریوتی مشخص می کند. الگوریتم های پیشنهادی در سه برنامه مجزا به زبان C++ رمز شده و بر روی ژنوم E. coli آزمایش شده اند. برنامه اول جهت استخراج اطلاعات لازم (ORF های بلند غیر همپوشان) برای تعلیم الگوریتم یادگیری ماشینی به صورت خودآموز (train- self) ارایه شده است. در برنامه دوم, از اطلاعات بدست آمده در مرحله قبل, برای تعلیم الگوریتم HMM طراحی شده, به عنوان اگوریتم یادگیری ماشینی در سامانه Gene finder استفاده شده است که دارای یک ساختار حلقه باز است,. در برنامه آخر, الگوریتم HMM تعلیم داده شده, ژن ها را بر اساس طول و نمره ORF بلند, در RF مربوطه انتخاب می کند. آخرین مرحله در طراحی نرم افزار, به رفع مساله همپوشانی در بین ژن های انتخاب شده, اختصاص داده شده است. نرم افزار طراحی شده که دارای عملکردی به صورت اختصاصی بوده (Specificity (SP=TP/(TP+ FP)) Sp و حساسیت (Sensitivity (Sn=TP/(TP+FN)) Sn به ترتیب برابر با 96.45 و 84.38 است, جایگاه مناسبی در بین نرم افزارهای مشابه دارد.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

    استناددهی

    APA: کپی

    ملک شاهی، رحیم، مهری دهنوی، علیرضا، بیگی، مجید، و پورحسین، معراج. (1386). یافتن ژن در ژنوم های پروکاریوتی با استفاده از مدل مخفی مارکوف. ژنتیک نوین، 2(1)، 47-54. SID. https://sid.ir/paper/116681/fa

    Vancouver: کپی

    ملک شاهی رحیم، مهری دهنوی علیرضا، بیگی مجید، پورحسین معراج. یافتن ژن در ژنوم های پروکاریوتی با استفاده از مدل مخفی مارکوف. ژنتیک نوین[Internet]. 1386؛2(1):47-54. Available from: https://sid.ir/paper/116681/fa

    IEEE: کپی

    رحیم ملک شاهی، علیرضا مهری دهنوی، مجید بیگی، و معراج پورحسین، “یافتن ژن در ژنوم های پروکاریوتی با استفاده از مدل مخفی مارکوف،” ژنتیک نوین، vol. 2، no. 1، pp. 47–54، 1386، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/116681/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources
    مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources
    مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources
    مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources
    مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources
    مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources
    مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources
    فایل موجود نیست.
    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button