مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

54
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

32
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

ردیابی و تجزیه و تحلیل ژنوم کامل ویروس بدشکلی برگ انگور (Grapevine deformation virus) از تاکستان های استان خراسان رضوی

صفحات

 صفحه شروع 171 | صفحه پایان 181

چکیده

 نپوویروس ها عامل زوال عفونی مو در سراسر دنیا هستند. ویروس بدشکلی برگ انگور (Grapevine deformation virus-GDefV) با نام جدید Nepovirus deformationis به زیرگروه A جنس نپوویروس تعلق دارد. علائم GDefV به صورت بدشکلی برگ انگور, کوتولگی و زوال درختچه است. GDefV در اغلب موارد در آلودگی مخلوط با ویروس برگ بادبزنی مو مشاهده می­شود. برای شناسایی و تعیین توالی ژنوم کامل GDefV سه نمونه انگور با علائم رشد کپه­ای و زوال در بهار سال 1398 از شهرستان کاشمر در استان خراسان رضوی در شمال شرق ایران جمع آوری شدند. پس از استخراج RNA از دمبرگ برگ های جوان مو, شناسایی اولیه GDefV در واکنش زنجیره ای پلیمراز انجام شد. سپس کتابخانه هایی از RNA های کوچک از سه تاک مورد بررسی تهیه و در پلت فرم ایلومینا تعیین توالی شدند. پس از پالایش خوانش ها, 15 میلیون خوانش باکیفیت مناسب برای آنالیزهای پایین دست باقی ماندند. که از آن­ها, ژنوم سه جدایه ایرانی GDefV به طول 7386 و 3753 نوکلئوتید بازسازی شد. مقایسه ترادف این جدایه­ها با توالی های GDefV موجود در GenBank بیانگر شباهت 3/94-6/87 درصدی در سطح نوکلئوتیدی و 5/90-8/88 درصد در سطح آمینواسیدی بود. در درخت های فیلوژنتیک ترسیم شده, جدایه های شمال شرق ایران در شاخه ای مجزا از سایر جدایه های GDefV قرار گرفتند. مقاله حاضر اولین گزارش از تحلیل ژنوم و تبارزایی جدایه های GDefV از تاکستان های ایران را ارائه می دهد.

چندرسانه ای

  • ثبت نشده است.

    • استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.

    • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button