مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

183
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

13
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

اصول و کاربردهای فناوری توالی یابی نسل جدید (NGS) در علوم زیستی (با رویکرد به نژادی غلات)

صفحات

 صفحه شروع 110 | صفحه پایان 231

کلیدواژه

توالی یابی نسل جدید (NGS) 

چکیده

 مقدمه: از زمان معرفی توالی یابی نسل جدید (NGS), در اوایل دهه 2000, این فناوری  به عنوان یکی از تحولات بنیادین در علوم زیستی, باعث پیشرفت چشمگیر در تحقیقات ژنومیک, ترنسکریپتوم , اپیژنوم و... شده است. اصول فناوری NGS شامل مباحث مربوط به تهیه کتابخانه , توالی یابی و تحلیل داده های حاصل از آن است. این فناوری با توالی یابی میلیون ها قطعه DNA به صورت موازی و با دقت بالا و هزینه پایین و  همچنین تولید حجم زیادی از داده های ژنومی در زمان کوتاه, توانسته است جایگزین روش های قدیمی تری مانند توالی یابی سنگر شود و با توالی یابی سریع, دقیق و کامل ژنوم ها و نواحی هدف انقلابی بزرگ در درک پیچیدگی های ژنتیکی, ساختار ژنوم و تعیین تنوع ژنتیکی ایجاد کند. از مهم ترین کاربردهای NGS در علوم زیستی می توان به شناسایی و مطالعه ژن های مرتبط با صفات کمی و کیفی, مطالعات تنوع ژنتیکی و ژنتیک جمعیت, تشخیص بیماری های ژنتیکی, اپیدمیولوژی, میکروبیوم شناسی, پزشکی قانونی, فیلوژنتیک, زیست شناسی سامانه ای, مهندسی ژنتیک و ویرایش ژنوم و  اصلاح نبات و دام اشاره کرد. بااین حال, استفاده مؤثر از داده های NGS مستلزم توسعه زیرساخت های محاسباتی قوی و الگوریتم های پیشرفته و همچنین گسترش اطلاعات محققان در رابطه با کاربردها و چالش های بیوانفورماتیکی مرتبط با داده های NGS, برای تحلیل و تفسیر این حجم عظیم از اطلاعات است.مواد و روش ها: مقاله حاضر یک مقاله مروری می­باشد که به شیوه تحلیل محتوا (Content analysis) با جستجوی کلید واژه های توالی­یابی نسل جدید (NGS), انواع توالی یابی NGS, تجزیه و تحلیل داده­های NGS, کاربردهای توالی یابیNGS , در مقاله های مرتبط در پایگاه­های اینترنتی PubMed ,Web of science ,Google scholar و Scopus به دست آمده است.یافته ها: این مطالعه قصد دارد با مرور تفصیلی توالی یابی های نسل اول, دوم و سوم , بررسی مسیر تجزیه و تحلیل داده های NGS و کاربردهای گسترده NGS در زمینه های مختلف از جمله تحقیقات غلات, راهنمایی تقریباً کاملی برای تجزیه و تحلیل کارآمد و بهینه داده های حاصل از توالی یابی نسل جدید ارائه نماید. به این منظور در بخش اول به مرور توالی یابی های نسل اول (ماکسام-گیلبرت و سنگر), نسل دوم (Illumina, ABI/SOLID, Roche/454 pyrosequencing, Ion Torrent) و نسل سوم (Heliscope, SMRT, Oxford Nanopore) پرداخته شد. سپس در بخش دوم انواع توالی یابی های NGS مانند: Whole genome sequencing; WGS, Whole exome sequencing; WES, Bulk RNA-seq و سایر روش ها معرفی و مسیر تجزیه و تحلیل آنها بررسی شده اند و در ادامه کاربرد توالی یابی نسل جدید در حوزه های مختف مانند شناسایی تنوعات ساختاری ژنومی (SVs), مطالعه تغییرات اپی ژنتیکی, تجزیه و تحلیل جمعیت میکروبی, کشاورزی (با تأکید بر بهنژادی غلات) توضیح داده شد. در نهایت مزایا و چالش های پیشروی توالی­یابی نسل جدید بیان گردید.نتیجه گیری: توالی یابی نسل جدید به عنوان یک فناوری انقلابی در ژنومیک, تأثیر بسزایی در تحقیقات علوم زیستی داشته است. کاهش هزینه ها و افزایش دقت توالی یابی به همراه توسعه روش های جدید, باعث شده است تا NGS به ابزاری کلیدی برای درک بهتر ژنتیک و توسعه راهبردهای درمانی شخصی سازی شده تبدیل شود. با پیشرفت های مداوم در این حوزه و ترکیب این فناوری با هوش مصنوعی, آینده ی NGS در تحلیل دقیق تر داده های ژنتیکی و بهبود فرایندهای درمانی بسیار روشن به نظر می رسد.

چندرسانه ای

  • ثبت نشده است.

    • استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.

    • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button