Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

1,253
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

0
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

افراز بلوکی هاپلوتیپ ها و انتخاب tagSNP تحت مدل فیلوژنی کامل

صفحات

 صفحه شروع 281 | صفحه پایان 289

کلیدواژه

چندریختی تک نوکلئوتیدی (Single Nucleotide PolymorphismQ3
SNP)Q3

چکیده

 چندریختی تک نوکلئوتیدی (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) رایج ترین شکل چندریختی در ژنوم انسان است. مطالعه تفاوت های ژنتیکی, وجود SNP - هاپلوتیپ های یکسان بین افراد مختلف جمعیت انسان را آشکار ساخته است. اشکال رایج این تفاوت های ژنتیکی از الگوی خاصی تبعیت می کنند که به شکل یک ساختار بلوک مانند بر روی ژنوم انسان مشاهده می شوند. در این تحقیق, شیوه تازه ای بر پایه مدل فیلوژنی کامل, برای تعیین بلوک های هاپلوتیپ با استفاده از نمونه هایی از ژنوم های فردی معرفی می شود. ما ابتدا تعریف دقیقی از کیفیت افراز هاپلوتیپ ها به بلوک ها ارائه می دهیم و بر مبنای آن, الگوریتمی حریصانه برای یافتن افراز موافق با شرایط فیلوژنی کامل و نیز فیلوژنی نزدیک به کامل طراحی می کنیم. بر این اساس اثبات می شود که مینیمم تعداد tagSNP را می توان با استفاده از الگوریتمی در زمان چندجمله ای بدست آورد. از طریق شبیه سازی, الگوریتم پیشنهادی و دیگر روش های موجود را از حیث توان شناسائی بلوک های هاپلوتیپ بر روی کروموزوم 21 انسان مورد مقایسه قرار می دهیم. نتایج بیانگر آنند که الگوریتم پیشنهادی در مقایسه با روش متعارف استفاده از آزمون چهار گامت که تا پیش از این, تنها روش مطرح در افراز بلوک های هاپلوتیپ تحت مدل فیلوژنی کامل بود به طور محسوس موفق تر است.

استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    APA: کپی

    اصلاح چی، چنگیز، کتانفروش، علی، پزشک، حمید، و افضلی، نرجس. (1390). افراز بلوکی هاپلوتیپ ها و انتخاب tagSNP تحت مدل فیلوژنی کامل. مجله بیوتکنولوژی ایران، 9(4)، 281-289. SID. https://sid.ir/paper/139340/fa

    Vancouver: کپی

    اصلاح چی چنگیز، کتانفروش علی، پزشک حمید، افضلی نرجس. افراز بلوکی هاپلوتیپ ها و انتخاب tagSNP تحت مدل فیلوژنی کامل. مجله بیوتکنولوژی ایران[Internet]. 1390؛9(4):281-289. Available from: https://sid.ir/paper/139340/fa

    IEEE: کپی

    چنگیز اصلاح چی، علی کتانفروش، حمید پزشک، و نرجس افضلی، “افراز بلوکی هاپلوتیپ ها و انتخاب tagSNP تحت مدل فیلوژنی کامل،” مجله بیوتکنولوژی ایران، vol. 9، no. 4، pp. 281–289، 1390، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/139340/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی





    بازگشت به بالا