مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

28
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با صفات کیفی پشم در گوسفندان نژاد پشم ضخیم و ظریف برپایه آماره های نشانه های انتخاب

صفحات

 صفحه شروع 133 | صفحه پایان 154

چکیده

 هدف: طی دهه­های اخیر تمایل به شناسایی مناطق ژنومی که هدف انتخاب برنامه های اصلاحی در دام های اهلی مانند گوسفند بوده­اند رو به افزایش بوده است. شناسایی نشانه­های انتخاب می­تواند دیدگاه­های ارزشمندی در مورد مناطق ژنومی که تحت انتخاب مثبت هستند فراهم کند که به نوبه خود منجر به درک بهتر ارتباط ژنوتیپ با فنوتیپ می­شود. هدف از این مطالعه, شناسایی ژن های کاندیدای و مناطق ژنومی تحت انتخاب مثبت مرتبط با صفات کیفی پشم در گوسفند از طریق روش های شناسایی ردپای انتخاب شامل FST و hapFLK می­باشد. مواد و روش ها: در این پژوهش اطلاعات ژنوتیپی مربوط به 146 رأس گوسفندان با حداقل روابط خویشاوندی مربوط به گوسفندان نژادهای زندی و مرینوس تعیین ژنوتیپ شده توسط آرایه­های50K  شرکت ایلومینا استفاده شد. پس از کنترل کیفیت داده­های اولیه تعیین ژنوتیپ شده در برنامه PLINK نهایتاً 46793 نشانگر SNP و 144 رأس دام وارد آنالیزهای بعدی شدند. برای شناسایی نواحی ژنومی تحت انتخاب از دو آزمون آماری برآوردگر نااریب FST (تتا) با کد نویسی در برنامه R و روش hapFLK بوسیله نرم­افزارhapFLK  نسخه 4/1 استفاده شد. ژن های کاندیدا با استفاده از SNP­هایی که در بازه ی 1/0 درصد ارزش بالای این دو آزمون واقع شده بودند, شناسایی شدند. همچنین برای تفسیر بهتر عملکرد ژن­های به دست آمده از پایگاه­های اطلاعاتی آنلاینGeneCards  و UniProtKB استفاده شد. نتایج: نتایج حاصل از آماره تتا در این پژوهش منجر به شناسایی هشت منطقه ژنومی روی کروموزوم­های 1 (دو منطقه), 2, 3 (دو منطقه), 10, 13 و 19 بودند و در صدک 9/99 کل ارزش­های تتا قرار داشتند. ژن­های کاندیدای شناسایی شده مرتبط با صفات کیفی پشم در این مناطق ژنومی شامل ژن­های POU1F1, FGF12,  GNAS, LHX2, TMTC3, NBEA و MITF بودند. آنالیز بیوانفورماتیکی نشان داد که مناطق ژنومی شناسایی شده با ژن­های مؤثر بر رشد و توسعه فولیکول­های مو, رشد و توسعه پوست, جعد, تفرق سلول­های اپیتلیال, رنگدانه­های پوست و تحریک کلاژن همپوشانی دارند. همچنین نتایج حاصل از آماره hapFLK در این پژوهش منجر به شناسایی چهار منطقه ژنومی روی کروموزوم­های 7, 10, 14 و 19 گردید. ژن­های کاندیدای شناسایی شده شامل DUOX1, RHPN2, و LOC106991379 بودند که عملکردهای متفاوتی در بیان ژن کراتینوسیت­ها و تمایز کلاژن­ها داشتند. نتیجه گیری: ژن­های گزارش شده در مناطق ژنومی شناسایی شده, براساس عملکرد می­توانند به­عنوان کاندیداهای تحت انتخاب مثبت مطرح باشند. به هر حال بررسی بیشتر ژن­های بدست آمده از طریق مطالعات تکمیلی ضروری است. نتایج این تحقیق می­تواند در درک ساز و کار ژنتیکی کنترل کننده صفات کمی و کیفی مرتبط با پشم با هدف افزایش مقدار پشم شسته­شده سالانه و کاهش میانگین قطر الیاف و ضریب تغییرات آن مورد استفاده قرار گیرد.

چندرسانه ای

  • ثبت نشده است.

    • استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.

    • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button