مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

657
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

508
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

بررسی گسترده ژنومی و آنالیز الگوی بیان خانواده ژنی HSP90 در گیاه آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری

صفحات

 صفحه شروع 134 | صفحه پایان 143

چکیده

 پروتئین های شوک حرارتی 90 کیلو دالتونی (HSP90), یک چاپرون مولکولی وابسته به ATP می باشند که توالی آن ها از درجه حفاظت شدگی بسیار بالایی در باکتری ها تا یوکاریوت ها برخوردار می باشند. در گیاهان, پروتئین های HSP90, برای کنترل رشد و نمو طبیعی گیاه و همچنین پاسخ دفاعی در برابر محرک های زیست محیطی مورد نیاز می باشند. گرچه مطالعات متعددی در مورد نقش فیزیولوژیکی HSP90ها در گیاهان وجود دارد, با این حال شناخت ما از مکانیسم های دفاعی پروتئین های HSP90 در پاسخ به تنش, نقش آن ها به عنوان چاپرون های مولکولی و برهم کنش های مولکولی آن ها با دیگر پروتئین ها و کوچاپرون ها محدود می باشد. بنابراین, در مطالعه حاضر, با آنالیز جامعی از خانواده ژنی HSP90 در گیاه هالوفیت Aeluropus littoralis, 4 ژن HSP90 در این گیاه شناسایی و با استفاده از آنالیز پیش بینی جایگاه سلولی مشخص شد که این ژن ها در بخش های مختلف سلولی فعال می باشند. با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی مختلفی, 45 ژن HSP90 نیز در سایر گونه های آرابیدوپسیس, برنج, ذرت, سویا وBrachypodium distachyon شناسایی گردید. 49 ژن HSP90 مورد بررسی, از نظر فیلوژنتیکی در سه گروه اصلی تقسیم بندی شدند. آنالیز ساختارهای ژنی و ترکیب موتیف ها نشان داد که این ژن ها در هر گروه تقریباً از حفاظت شدگی بالایی برخوردارند, که بیانگر این است که اعضای هر گروه ممکن است دارای کارکردهای یکسانی باشند. بر اساس داده های RNA-seq, ژن AlHSP90. 4 فعال در سیتوپلاسم با سطح بیان 3/1, ببیشترین بیان را در بافت ریشه تحت شرایط تنش شوری و بازیابی به نمایش گذاشت. حداقل سطح بیان, نیز در ژن AlHSP90. 3 واقع در شبکه آندوپلاسمی, در پاسخ به تنش شوری و در شرایط بازیابی در بافت برگی مشاهده گردید. یافته های این بررسی, ضمن ارائه خصوصیات عملکردی ژن های AlHSP90, اطلاعات پایه ای را برای تحقیقات آتی در مورد کارکرد بیولوژیکی این ژن ها مهیا می سازد.

استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    APA: کپی

    هاشمی پطرودی، سیدحمیدرضا، نعمت زاده، قربانعلی، محمدی، سمیرا، و کولمن، مارکوس. (1398). بررسی گسترده ژنومی و آنالیز الگوی بیان خانواده ژنی HSP90 در گیاه آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری. پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، 11(31 )، 134-143. SID. https://sid.ir/paper/181093/fa

    Vancouver: کپی

    هاشمی پطرودی سیدحمیدرضا، نعمت زاده قربانعلی، محمدی سمیرا، کولمن مارکوس. بررسی گسترده ژنومی و آنالیز الگوی بیان خانواده ژنی HSP90 در گیاه آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری. پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی[Internet]. 1398؛11(31 ):134-143. Available from: https://sid.ir/paper/181093/fa

    IEEE: کپی

    سیدحمیدرضا هاشمی پطرودی، قربانعلی نعمت زاده، سمیرا محمدی، و مارکوس کولمن، “بررسی گسترده ژنومی و آنالیز الگوی بیان خانواده ژنی HSP90 در گیاه آلوروپوس لیتورالیس تحت تنش شوری،” پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، vol. 11، no. 31 ، pp. 134–143، 1398، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/181093/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی





    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button