مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

1,610
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

879
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

بارکدگذاری DNA برخی از گیاهان دارویی

صفحات

 صفحه شروع 31 | صفحه پایان 40

کلیدواژه

ITSQ2

چکیده

 بارگذاری DNA روشی ساده برای شناسایی گونه ها با استفاده از یک توالی کوتاه ژنتیکی از یک بخش استاندارد ژنوم است. این روش به منظور شناسایی هشت گیاه دارویی جمع آوری شده از استان اردبیل مورد استفاده واقع شد. استخراج DNA به روش تغییریافته CTAB انجام گرفت و PCR با آغازگرهای طراحی شده بر اساس بارکدهای کلروپلاستی rbcL, trnH-psbA, matK و بارکد هسته ای ITS انجام شد. سپس محصولات PCR خالص سازی و تعیین توالی گردید. درصد موفقیت تکثیر و توالی یابی در نمونه ها به ترتیب 87 و 62, 75 و 37, 62 و 12, 75 و 37 به دست آمد. توالی ها با نمونه های موجود در پایگاه داده NCBI همردیف شده و تحت تجزیه بیوانفورماتیکی قرار گرفتند. در درخت خویشاوندی گونه های هم جنس بر اساس توالی های بارکدهای rbcL و trnH-psbA از دیگر جنس ها تفکیک شدند. همچنین, در بارکد ITS فقط شیرین بیان با گیاهان هم جنس خود قرار گرفت. در این مطالعه, گیاه سوسن چلچراغ برای اولین بار با بارکد rbcL بارکدگذاری شد. SNP بارکدهای rbcL (کم تر از 30), trnH-psbA (کم تر از 100), ITS (بیشتر از 200) و matK (کمتر از 20) شمارش شد. بنابراین, بارکد rbcL به دلیل قدرت تفکیک بالا, تعداد SNP پایین و جامعیت در اکثر گونه ها, به عنوان بهترین بارکد معرفی شد. با وجود این, بارکدهای ITS و trnH-psbA به دلیل مشکل مرتبط با توالی یابی مستقیم محصولات PCR و عدم دسترسی به توالی های با کیفیت, به عنوان بارکدهای مکمل شناسایی شدند. بارکد matK به دلیل قدرت تکثیر و توالی یابی پایین برای نمونه های مورد بررسی توصیه نمی شود.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    اسدی، فاطمه، دژستان، سارا، قهرمان زاده، رباب، رزمجو، جبرائیل، و آل ابراهیم، محمدتقی. (1394). بارکدگذاری DNA برخی از گیاهان دارویی. زیست فناوری گیاهان زراعی، 4(10)، 31-40. SID. https://sid.ir/paper/226783/fa

    Vancouver: کپی

    اسدی فاطمه، دژستان سارا، قهرمان زاده رباب، رزمجو جبرائیل، آل ابراهیم محمدتقی. بارکدگذاری DNA برخی از گیاهان دارویی. زیست فناوری گیاهان زراعی[Internet]. 1394؛4(10):31-40. Available from: https://sid.ir/paper/226783/fa

    IEEE: کپی

    فاطمه اسدی، سارا دژستان، رباب قهرمان زاده، جبرائیل رزمجو، و محمدتقی آل ابراهیم، “بارکدگذاری DNA برخی از گیاهان دارویی،” زیست فناوری گیاهان زراعی، vol. 4، no. 10، pp. 31–40، 1394، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/226783/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button