مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

844
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

699
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

بررسی مقایسه ای ترنسکریپتوم برگ برنج تحت شرایط کنترل و تنش خشکی با استفاده از داده های EST

صفحات

 صفحه شروع 1 | صفحه پایان 15

کلیدواژه

برچسب توالی های بیان شده (EST)Q2

چکیده

 برنج غذای اصلی بیش از نیمی از جمعیت جهان به ویژه کشورهای در حال توسعه است و خشکی مهمترین عامل کاهش عملکرد برنج در آسیا می باشد. این تحقیق به منظور شناسایی ژن های پاسخ دهنده به تنش خشکی با کمک تجزیه و تحلیل اطلاعات EST دو کتابخانه برگ برنج انجام شد. داده های کتابخانه های EST در شرایط شاهد و تنش خشکی, از پایگاه داده NCBI دریافت و با استفاده از نرم افزار EGassembler ویرایش, دسته بندی و هم گذاری شدند. توالی های کانتیگ و سینگلتون به دست آمده به عنوان الگو برای جستجوی بلاست x در بانک توالی پروتیین برنج و انتساب گروه عملکردی با استفاده از نرم افزار CLC Genomic Workbench و AgriGO به کار برده شدند. پروتئین های شناسایی شده در کتابخانه های شاهد و خشکی به ترتیب در70 و 82 گروه کارکردی مختلف قرار گرفتند. برای شناسایی تفاوت های معنی دار بین گروه های کارکردی در کتابخانه های شاهد و تنش خشکی از نرم افزار IDEG6 استفاده شد. بررسی هستی شناسی ژن ها, تفاوت معنی دار در 20 گروه عملکردهای مولکولی, 35 گروه فرایندهای زیستی و 12 گروه اجزای درون سلول را آشکار ساخت. به منظور تعیین بیان افتراقی ژن ها بین دو کتابخانه, 4012 EST دارای کد Unigene با استفاده از الگوریتم پیاده سازی شده در نرم افزار MATLAB انتخاب و با استفاده از نرم افزار IDEG6 تفاوت معنی دار بین 42 ژن تحت تنش خشکی نسبت به شاهد, مشاهده شد (31 ژن افزایش و 11 ژن کاهش بیان). ژن های افزایش بیان یافته, در پاسخ به تنش های محیطی و اکسیداتیو, برقراری هموستازی, پروتئولیز و گلیکولیز نقش داشته و ژن های مربوط به فتوسنتز کاهش بیان نشان دادند.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    حیدری، منظر، شبر، زهراسادات، کوباز، پریسا، و حیدری، محمدجواد. (1395). بررسی مقایسه ای ترنسکریپتوم برگ برنج تحت شرایط کنترل و تنش خشکی با استفاده از داده های EST. زیست فناوری گیاهان زراعی، 5(14)، 1-15. SID. https://sid.ir/paper/226811/fa

    Vancouver: کپی

    حیدری منظر، شبر زهراسادات، کوباز پریسا، حیدری محمدجواد. بررسی مقایسه ای ترنسکریپتوم برگ برنج تحت شرایط کنترل و تنش خشکی با استفاده از داده های EST. زیست فناوری گیاهان زراعی[Internet]. 1395؛5(14):1-15. Available from: https://sid.ir/paper/226811/fa

    IEEE: کپی

    منظر حیدری، زهراسادات شبر، پریسا کوباز، و محمدجواد حیدری، “بررسی مقایسه ای ترنسکریپتوم برگ برنج تحت شرایط کنترل و تنش خشکی با استفاده از داده های EST،” زیست فناوری گیاهان زراعی، vol. 5، no. 14، pp. 1–15، 1395، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/226811/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button