مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

689
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

638
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

پیش بینی شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین در گیاه جو براساس روش اینترولوگ

صفحات

 صفحه شروع 557 | صفحه پایان 564

چکیده

 جو (Hordeum vulgare) گیاهی یک ساله از خانواده Poaceae است. این گیاه از غلات مهم مورد استفاده انسان بوده و در بسیاری از موارد جایگزین گندم شده است. محدودیت های مربوط به روش های آزمایشگاهی شناسایی برهمکنش های پروتئینی را با مشکل روبه رو کرده است. در سال های اخیر روش های محاسباتی گام موثری در پرکردن خلا موجود برداشته و نقش مهمی در زمینه پیش بینی و شناسایی برهمکنش های پروتئینی ایفا کرده است. در این مطالعه به منظور ساخت شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین گیاه جو از اطلاعات برهمکنش های پروتئین-پروتئین مربوط به شش ارگانیزم مدل شامل ساکارومایسس سروزیه (Saccharomyces cerevisiae), سینورابتیدیس الگانس یا نماتد (Caenorhabditis elegans), دروزوفیلا ملانوگاستر یا مگس میوه (Drosophila melanogaster), انسان (Homo sapiens), برنج (Oryza sativa) و آرابیدوپسیس تالیانا (Arabidopsis thaliana) استخراج شده از پایگاه داده Intact استفاده شد و استخراج اطلاعات ارتولوگ های گیاه جو با ارگانیزم های مدل با استفاده از Inparanoid صورت گرفت. روش اینترولوگ که در این مطالعه مورد استفاده قرار گرفته است, از منطبق کردن برهمکنش های پروتئینی ارگانیزم های مدل بر ارتولوگ های گیاه جو استفاده کرده و منجر به پیش بینی 247745 برهمکنش پروتئین-پروتئین شد که پس از حذف برهمکنش های تکراری 235966 برهمکنش غیرتکراری بین 7350 پروتئین به دست آمد. مطالعه صورت گرفته اولین گزارش ارایه شده در زمینه پیش بینی شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین گیاه جو است.

استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    APA: کپی

    حکمتی، ژاله، اعلمی، علی، و ظهیری، جواد. (1398). پیش بینی شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین در گیاه جو براساس روش اینترولوگ. زیست فناوری، 10(4 )، 557-564. SID. https://sid.ir/paper/231267/fa

    Vancouver: کپی

    حکمتی ژاله، اعلمی علی، ظهیری جواد. پیش بینی شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین در گیاه جو براساس روش اینترولوگ. زیست فناوری[Internet]. 1398؛10(4 ):557-564. Available from: https://sid.ir/paper/231267/fa

    IEEE: کپی

    ژاله حکمتی، علی اعلمی، و جواد ظهیری، “پیش بینی شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین در گیاه جو براساس روش اینترولوگ،” زیست فناوری، vol. 10، no. 4 ، pp. 557–564، 1398، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/231267/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی





    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button