مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

1,752
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

645
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی توالی های EST کلاله زعفران (.Crocus sativus L) به منظور تعیین جهت گیری کارکردی ژنوم و شبکه ژنی

صفحات

 صفحه شروع 39 | صفحه پایان 52

چکیده

 روش های ژنومیکس کارکردی نظیر تجزیه و تحلیل توالی های EST, امکان شناسایی, بررسی بیان و مطالعه رونوشت های ژنی درگیر در شبکه های تنظیمی و متابولیکی را فرآهم آورده اند. در این پژوهش به منظور شناسایی جهت گیری کارکردی ژنوم و تعیین شبکه ژنی درگیر در تکامل کلاله زعفران, 6202 توالی EST مربوط به کتابخانه کلاله بالغ زعفران مورد بررسی و تحلیل قرار گرفتند. پس از پیرایش اولیه توالی ها, دسته بندی و هم گذاری آنها انجام شد که منتج به ایجاد 910 unigene (604 کانتیگ و 304 سینگلتون) گردید. جستجوی بلاست ایکس نشان داد که 570 unigene دارای hit مشخص در بین پروتئین های آرابیدوپسیس بودند و برای سایر توالی ها hit مشخصی شناسایی نشد. گروه بندی و  Gene enrichment analysis  توالی ها آنها را در 31 گروه کارکردی مختلف قرار داد که حضور 12 گروه در سطح آماری 1% معنی دار گردید. شبکه ژنی مربوط به توالی های با حضور بالا (بیش از 20 رونوشت), نشان داد که ارتباطات ژنی پیچیده ای در کلاله بالغ زعفران وجود دارد. نتایج مشخص نمود که مسیر علامت دهی جاسمونیک اسید و عوامل رونویسی مربوط به آن همچون  MYB21و Zinc finger ها سهم بزرگی از شبکه تنظیمی را به خود اختصاص می دهند و نقش کلیدی در تنظیم متابولیسم اولیه و ثانویه کلاله و به خصوص متابولیسم کارتنوئیدها (به عنوان مهم ترین متابولیت های زعفران), بر عهده دارند. ژن های شناسایی شده در این پژوهش می توانند نامزدهای مناسبی برای دست ورزی تکامل و متابولیسم کلاله زعفران باشند.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    علی اکبری، معصومه، شاملودشت پاگردی، روح اله، و ابراهیمی، اسماعیل. (1392). تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی توالی های EST کلاله زعفران (.Crocus sativus L) به منظور تعیین جهت گیری کارکردی ژنوم و شبکه ژنی. زراعت و فناوری زعفران، 1(1)، 39-52. SID. https://sid.ir/paper/247907/fa

    Vancouver: کپی

    علی اکبری معصومه، شاملودشت پاگردی روح اله، ابراهیمی اسماعیل. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی توالی های EST کلاله زعفران (.Crocus sativus L) به منظور تعیین جهت گیری کارکردی ژنوم و شبکه ژنی. زراعت و فناوری زعفران[Internet]. 1392؛1(1):39-52. Available from: https://sid.ir/paper/247907/fa

    IEEE: کپی

    معصومه علی اکبری، روح اله شاملودشت پاگردی، و اسماعیل ابراهیمی، “تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی توالی های EST کلاله زعفران (.Crocus sativus L) به منظور تعیین جهت گیری کارکردی ژنوم و شبکه ژنی،” زراعت و فناوری زعفران، vol. 1، no. 1، pp. 39–52، 1392، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/247907/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button