Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

712
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

624
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

شناسایی و آنالیز پروموتر ژن های کلیدی دخیل در تحمل به تنش خشکی در مرحله زایشی جو با استفاه از آنالیز داده های ریزآرایه

صفحات

 صفحه شروع 67 | صفحه پایان 79

چکیده

 خشکی مهم ترین تنش محیطی است که باعث کاهش عملکرد محصولات گیاهی می شود. تحقیقات در راستای ایجاد ارقام متحمل به تنش خشکی از اهمیت فوق العاده ای برخوردار است. در این تحقیق تلاش شده است تا با آنالیز داده های تولید شده از طریق فناوری ریزآرایه, ژن های مهم پاسخگو به تنش خشکی و ژن های هاب در مرحله زایشی جو شناسایی شده و آنالیز پروموتور انجام گیرد. به همین منظور با استفاده از نرم افزار FlexArray تمامی ژن های دارای بیان افتراقی 5/2 ≥ و 5/2-≥ در بین دو سری از آزمایشات ریزآرایه انجام شده در جو شناسایی شدند. نتیجه این تجزیه و تحلیل, شناسایی 559 ژن پاسخ دهنده به تنش خشکی در مرحله زایشی بود. ژن های هاب با استفاده از سه الگوریتم محاسباتی Cyto-Hubba در نرم-افزار Cytoscape مشخص شدند. این امر منجر به شناسایی 10 ژن غیر تکراری شد که به عنوان مؤثرترین ژن ها در پاسخ به تنش خشکی در نظر گرفته شدند. براساس بررسی هستی شناسی ژن های دارای بیان افتراقی و ژن های هاب, تنظیم رونویسی از گروه های اصلی بود که نشان دهنده اهمیت عوامل رونویسی در مکانیسم تحمل به خشکی می باشد. در میان عوامل رونویسی می توان به HvCBF6, HvDRF1. 3, LFL1, VP1, WRKY71 و ABI5 (متعلق به خانواده های AP2, WRKY و bZIP) اشاره کرد. آنالیز پرموتر نشان داد که برخی از خانواده های عوامل رونویسی از جمله AP2, AT-hook family, bHLH, NAC, bZIP و MYB قابلیت اتصال به 85 درصد از پرموترهای شناسایی شده را دارند. مطالعه این عوامل رونویسی, می تواند به شناخت هر چه بیشتر سازوکار تحمل به تنش خشکی در جو کمک کند.

استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    APA: کپی

    جوادی، سیدمهری، شبر، زهراسادات، ابراهیمی، آسا، و شهبازی، مریم. (1399). شناسایی و آنالیز پروموتر ژن های کلیدی دخیل در تحمل به تنش خشکی در مرحله زایشی جو با استفاه از آنالیز داده های ریزآرایه. زیست فناوری گیاهان زراعی، 9(29 )، 67-79. SID. https://sid.ir/paper/357244/fa

    Vancouver: کپی

    جوادی سیدمهری، شبر زهراسادات، ابراهیمی آسا، شهبازی مریم. شناسایی و آنالیز پروموتر ژن های کلیدی دخیل در تحمل به تنش خشکی در مرحله زایشی جو با استفاه از آنالیز داده های ریزآرایه. زیست فناوری گیاهان زراعی[Internet]. 1399؛9(29 ):67-79. Available from: https://sid.ir/paper/357244/fa

    IEEE: کپی

    سیدمهری جوادی، زهراسادات شبر، آسا ابراهیمی، و مریم شهبازی، “شناسایی و آنالیز پروموتر ژن های کلیدی دخیل در تحمل به تنش خشکی در مرحله زایشی جو با استفاه از آنالیز داده های ریزآرایه،” زیست فناوری گیاهان زراعی، vol. 9، no. 29 ، pp. 67–79، 1399، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/357244/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی





    بازگشت به بالا