مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

240
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

476
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

بررسی بیوانفورماتیکی پروتئین شوک حرارتی جدایه های ایرانی ویروس زردی کلروتیک کدوئیان (Cucurbit chlorotic yellows virus) در افزایش تفاوت ژنتیکی

صفحات

 صفحه شروع 41 | صفحه پایان 47

کلیدواژه

پروتئین همولوگ شوک حرارتی (HSP70h)Q1

چکیده

 پروتیین شوک حرارتی در کلستروویروس ها نقش های متعددی به ویژه حرکت سلول-به-سلول را برای ایجاد آلودگی سیستمیک بر عهده دارد. در پژوهش حاضر, تفاوت ژنتیکی ژن همولوگ پروتیین شوک حرارتی (HSP70h) جدایه های ایرانی ویروس زردی کلروتیک کدوییان و همچنین فشار انتخاب وارد شده بر آن ها بررسی شد. به این منظور تعداد 195 نمونه با علایم زردی, کوتولگی و بدشکلی برگ ها از مزارع کدوییان استان سیستان و بلوچستان جمع آوری و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی, از منطقه ژنتیکی پروتیین همولوگ شوک حرارتی ویروس CCYV قطعه ای به طول 462 جفت باز برای 15 نمونه توسط روش RT-PCR تکثیرشد و 7 جدایه مورد بررسی فیلوژنتیکی قرار گرفت. نتایج به دست آمده نشانگر آلودگی 7 درصد نمونه ها به ویروس زردی کلروتیک کدوییان در مناطق مورد بررسی بود. آنالیزفیلوژنی توالی های نوکلیوتیدی و اسید آمینه ای جدایه های CCYV را به دو گروه ایرانی و شرق آسیا تقسیم نمود و جدایه های سیستان و بلوچستان در دو شاخه مجزا قرارگرفتند. هم ردیفی توالی اسیدآمینه فرضی پروتیین همولوگ شوک حرارتی و مطالعات فشار انتخاب بر روی 7 جدایه موجود در تحقیق با 3 جدایه ایرانی و جدایه های خارجی این ویروس نشان داد که ژن HSP70h در جدایه های ایرانی و سایر جدایه های این ویروس تحت فشار انتخاب مثبت در کدون 82 قرار دارند که منجر به تغییر یک اسید نوکلییک (CTC به TTC) به ترتیب برای جدایه های مرکزی و جدایه های زابل, هیرمند و نیمروز در موقعیت 244 شده و اسید آمینه لوسین به فنیل آلانین در پروتیین همولوگ شوک حرارتی تغییر نموده است. نتایج نشان دهنده وجود جدایه های متنوع ویروس CCYV در کشور بوده و تفاوت در توالی نوکلیوتیدی و اسیدآمینه ای می تواند حاکی از تفاوت در منشا میزبانی باشد بنابراین فشار انتخاب در تنوع ژنتیکی جدایه ها دخالت داشته است.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    صادقی، زهرا، نصراله نژاد، سعید، لگزیان، میلاد، رضوی، سیداسماعیل، و جعفری، مجید. (1399). بررسی بیوانفورماتیکی پروتئین شوک حرارتی جدایه های ایرانی ویروس زردی کلروتیک کدوئیان (Cucurbit chlorotic yellows virus) در افزایش تفاوت ژنتیکی. ژنتیک نوین، 15(1 )، 41-47. SID. https://sid.ir/paper/368890/fa

    Vancouver: کپی

    صادقی زهرا، نصراله نژاد سعید، لگزیان میلاد، رضوی سیداسماعیل، جعفری مجید. بررسی بیوانفورماتیکی پروتئین شوک حرارتی جدایه های ایرانی ویروس زردی کلروتیک کدوئیان (Cucurbit chlorotic yellows virus) در افزایش تفاوت ژنتیکی. ژنتیک نوین[Internet]. 1399؛15(1 ):41-47. Available from: https://sid.ir/paper/368890/fa

    IEEE: کپی

    زهرا صادقی، سعید نصراله نژاد، میلاد لگزیان، سیداسماعیل رضوی، و مجید جعفری، “بررسی بیوانفورماتیکی پروتئین شوک حرارتی جدایه های ایرانی ویروس زردی کلروتیک کدوئیان (Cucurbit chlorotic yellows virus) در افزایش تفاوت ژنتیکی،” ژنتیک نوین، vol. 15، no. 1 ، pp. 41–47، 1399، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/368890/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button