Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

370
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

451
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

آنالیز بیانِ ژن ها و رسم شبکة ژنی آپوپتوزیس در نژادهای مرغ بومی اصفهان و تجاری راس تحت داده های RNA-seq

صفحات

 صفحه شروع 117 | صفحه پایان 130

چکیده

 در این مطالعه با استفاده از داده های توالی یابی RNA-seq, به دست آمده از 12 قطعه مرغِ ماده, بومی اصفهان و تجاری راس به بررسی ژن های با بیان متفاوت, به شناسایی مهمترین ژن های مؤثر در سیستم آپوپتوزیز و تقویت آن پرداخته شد. در این بررسی کیفیت داده ها با استفاده از نرم افزار FastQC سنجیده شد. پس از حذف خوانش های بی کیفیت, با استفاده از نرم افزار Trimmomatic, نقشه یابی داده ها با استفاده از نرم افزار TOP HAT2 انجام گرفت. شبکة ژنی آپوپتوزیز توسط پایگاه استرینگ رسم و آنالیز شد. تحلیل شبکه نشاندهنده معنی داریِ شبکه بوده و میزان و چگونگی ارتباط ژن ها مشخص شد. نتایج حاصل از بررسی ترنسکریپتوم های سیستم ایمنی با استفاده از Cuffdif نشان داد که از بین 1328 ژن دارای تفاوت بیان معنی دار در سیستم ایمنی, 11 ژن مربوط به آپوپتوزیز بود. همچنین ژن PIK3CD دارای بیشترین مقدارِ بیان در دو نژاد بومی و تجاری و PIK3CB دارای کمترین مقدارِ بیان در نژاد بومی بودند. بیشترین معنی داری در فرایندهای بیولوژیکی بر اساس آماره Bonferroni, مربوط به مسیرِ علامت دهی وابسته به اینوزیتول و بر اساس آماره P-value مربوط به مسیرِ تنظیم موضعی کردن پروتئین به سمت هسته می باشد. آنالیز شبکه ژنیِ آپوپتوزیز, منجر به شناسایی دو زیر شبکه (کلاستر) گردید که ژن شاخص آنها به ترتیب PIK3R1 و IL1R1 می باشد.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    حسانی، ژیلا، نصیری، محمدرضا، بختیاری زاده، محمدرضا، طهمورث پور، مجتبی، و جوادمنش، علی. (1397). آنالیز بیانِ ژن ها و رسم شبکة ژنی آپوپتوزیس در نژادهای مرغ بومی اصفهان و تجاری راس تحت داده های RNA-seq. پژوهش های علوم دامی ایران، 10(1 )، 117-130. SID. https://sid.ir/paper/384835/fa

    Vancouver: کپی

    حسانی ژیلا، نصیری محمدرضا، بختیاری زاده محمدرضا، طهمورث پور مجتبی، جوادمنش علی. آنالیز بیانِ ژن ها و رسم شبکة ژنی آپوپتوزیس در نژادهای مرغ بومی اصفهان و تجاری راس تحت داده های RNA-seq. پژوهش های علوم دامی ایران[Internet]. 1397؛10(1 ):117-130. Available from: https://sid.ir/paper/384835/fa

    IEEE: کپی

    ژیلا حسانی، محمدرضا نصیری، محمدرضا بختیاری زاده، مجتبی طهمورث پور، و علی جوادمنش، “آنالیز بیانِ ژن ها و رسم شبکة ژنی آپوپتوزیس در نژادهای مرغ بومی اصفهان و تجاری راس تحت داده های RNA-seq،” پژوهش های علوم دامی ایران، vol. 10، no. 1 ، pp. 117–130، 1397، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/384835/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.
  • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا