Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

1,173
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

265
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

آنالیز ترادف نوکلئوتیدی ناحیه 3 ژنوم جدایه های ویروس موزائیک رگه ای گندم در ایران

صفحات

 صفحه شروع 253 | صفحه پایان 255

چکیده

 تعدادی جدایه ویروس موزائیک رگه ای گندم در مناطق مختلف ایران از گندم یا گیاهان دیگر جمع آوری و پس از تشخیص سرولوژیکی ویروس, ترادف ناحیه ترجمه نشدنی (UTR) در انتهای 3 ژنوم آن تعیین گردید. برای اینکار آر. ان. ای. ویروس با mRNA capture kit جذب و cDNA با آغازگر (oligo dT) RCF1 تهیه شد. در واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) با استفاده از جفت آغازگر اختصاصی WSM1/ WSM2 یک قطعه 251 نوکلئوتیدی در ناحیه 3 ژنوم تکثیر شد. قطعه تکثیر شده در پلاسمید pTZ57R/ T وارد و در باکتری E. coli DH5a همسانه سازی شد. پلاسمید همسانه سازی شده استخراج و ترادف قطعه وارد شده تعیین و با ترادف سایر جدایه های WSMV موجود در GenBank مربوط به اروپا, استرالیا, آمریکا و ترکیه با برنامه CLUSTAL همردیف سازی چند گانه (multiple alignment) شد و درخت فیلوژنتیکی ترسیم گردید. تشابه نوکلئوتیدی در برنامه MegAlign محاسبه گردید. براساس رابطه فیلوژنتیکی مشخص شد که کلیه سویه ها و جدایه های دنیا در چهار گروه قرار می گیرند. در این آنالیز جدایه های ایران در دو شاخته کاملا مجزا قرار گرفتند. جدایه های فلات مرکزی و جنوبی ایران یک گروه کاملا مستقل و جدایی در درخت فیلوژنتیکی تشکیل دادند و جدایه های ویروس از شمال غرب کشور همراه با استرین های اروپایی در گروه دیگری قرار گرفتند.براساس این آنالیز دو خط سیر تکاملی در ایران ویروس وجود دارد, یکی در شمال غرب کشور و دیگری در فلات مرکزی و جنوبی ایران. بر این اساس تمام جدایه های این ویروس جد مشترکی دارند و از منطقه هلال حاصلخیز سرچشمه گرفته اند و سپس به علت جدایی جغرافیایی در دو مسیر تکاملی واگرا شده اند. این نتایج می تواند در برنامه های یافتن ژنهای مقاوم و اصلاح گندم مفید باشد.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    معصومی، محمود، یاسایی، سیدمحسن، زارع، آوا، افشاری فر، علیرضا، و ایزدپناه، کرامت اله. (1385). آنالیز ترادف نوکلئوتیدی ناحیه 3 ژنوم جدایه های ویروس موزائیک رگه ای گندم در ایران. بیماریهای گیاهی، 42(2 (پیاپی 166))، 253-255. SID. https://sid.ir/paper/386208/fa

    Vancouver: کپی

    معصومی محمود، یاسایی سیدمحسن، زارع آوا، افشاری فر علیرضا، ایزدپناه کرامت اله. آنالیز ترادف نوکلئوتیدی ناحیه 3 ژنوم جدایه های ویروس موزائیک رگه ای گندم در ایران. بیماریهای گیاهی[Internet]. 1385؛42(2 (پیاپی 166)):253-255. Available from: https://sid.ir/paper/386208/fa

    IEEE: کپی

    محمود معصومی، سیدمحسن یاسایی، آوا زارع، علیرضا افشاری فر، و کرامت اله ایزدپناه، “آنالیز ترادف نوکلئوتیدی ناحیه 3 ژنوم جدایه های ویروس موزائیک رگه ای گندم در ایران،” بیماریهای گیاهی، vol. 42، no. 2 (پیاپی 166)، pp. 253–255، 1385، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/386208/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا