مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

291
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

617
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

شناسایی و تأیید miRNAهای جدید مشترک در گندم نان و گونه های مختلف اجیلوپس با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی و Real time PCR

صفحات

 صفحه شروع 73 | صفحه پایان 83

چکیده

 گندم نان یکی از غلات مهم است که به طور وسیع در جهان کشت می شود. miRNA ها یک نوع از RNA های کوچک تنظیمی هستند که حدود 18-22 نوکلئوتیدی بوده و می توانند به عنوان یک ابزار اصلاحی جدید در بهبود ژنتیکی گیاهان عمل کنند. با توجه به اینکه بسیاری از miRNA ها از نظر تکاملی در بین قلمرو گیاهان و جانوران محافظت شده هستند, استفاده از ژنومیکس مقایسه ای و روش های محاسباتی برای شناسایی miRNA ها, بسیار مورد توجه است. در این مطالعه شناسایی miRNA بالقوه جدید در گندم نان مورد نظر بود و از یک روش جستجوی مبتنی بر تشابه روی EST برای اینکار استفاده شد. بدین منظور miRNA-های شناخته شده گیاهی به عنوان مرجع در برابر EST های گندم قرار گرفته و BLASTn انجام شد. سپس توالی های کد کننده پروتئین توسط BLASTx شناسایی و حذف شدند. در مرحله بعد ساختار ثانویه مورد بررسی قرار گرفت و سپس miRNA های کاندید در پایگاه اطلاعاتی Rfam بررسی شدند. در نهایت سه miRNA جدید با استفاده از این روش شناسایی شد که از نظر توالی, مشابه miRNA های شناخته شده در اجیلوپس تائوشی بودند. به منظور تأیید وجود آنها در گندم و گونه های اجیلوپس حاوی ژنوم D شامل تائوشی, سیلندریکا و کراسا, از Real time PCR استفاده شد و در نهایت وجود توالی myseq2 در ساقه گیاهان مورد مطالعه تأیید شد. شناسایی ژن های miRNA تأیید شده نشان داد که بیشتراین ژن ها مانند RGA, PIK و NB-ARC روی مقاومت به بیماری های مختلف تأثیر داشته و برخی نیز در مقاومت به تنش های غیر زیستی از جمله تنش خشکی و شوری نقش داشتند. نتیجه تحقیق تأیید کرد که روش های محاسباتی ابزار مناسبی برای پیش بینی miRNA های کاندید می تواند باشد که سبب صرفه جویی در وقت و هزینه شناسایی miRNA ها می شود.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    براتی، مرتضی، عظیمی، محمدرضا، نقوی، محمدرضا، و محسنی فرد، احسان. (1400). شناسایی و تأیید miRNAهای جدید مشترک در گندم نان و گونه های مختلف اجیلوپس با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی و Real time PCR. ژنتیک نوین، 16(1 )، 73-83. SID. https://sid.ir/paper/393525/fa

    Vancouver: کپی

    براتی مرتضی، عظیمی محمدرضا، نقوی محمدرضا، محسنی فرد احسان. شناسایی و تأیید miRNAهای جدید مشترک در گندم نان و گونه های مختلف اجیلوپس با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی و Real time PCR. ژنتیک نوین[Internet]. 1400؛16(1 ):73-83. Available from: https://sid.ir/paper/393525/fa

    IEEE: کپی

    مرتضی براتی، محمدرضا عظیمی، محمدرضا نقوی، و احسان محسنی فرد، “شناسایی و تأیید miRNAهای جدید مشترک در گندم نان و گونه های مختلف اجیلوپس با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی و Real time PCR،” ژنتیک نوین، vol. 16، no. 1 ، pp. 73–83، 1400، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/393525/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button