مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

391
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

516
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

تعیین توالی کامل RNA2 یک جدایه از ویروس موزاییک کدو (SqMV) از استان خراسان جنوبی در ایران

صفحات

 صفحه شروع 135 | صفحه پایان 141

چکیده

 ویروس موزاییک کدو (Squash mosaic virus, SqMV), تقریبا در تمامی نقاط کشت این محصول در دنیا گسترده بوده, و یکی از عوامل مهم خسارت و کاهش بازارپسندی این محصول می باشد. به منظور شناسایی و بررسی برخی از خصوصیات مولکولی ویروس موزاییک کدو, در سال 1394 از مزارع عمده کشت خربزه در استان خراسان جنوبی, تعداد 62 نمونه برگی دارای علائم جمع آوری شد. نمونه های جمع آوری شده توسط آزمون مولکولی RT-PCRمورد بررسی قرار گرفتند. در این آزمون با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده مربوط به پروتئین پوششی, قطعه ای به طول bp1900 جهت شناسایی نمونه های آلوده تکثیر گردید. سپس از بین نمونه های آلوده, یک نمونه (شهرستان طبس) انتخاب, و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده, RNA2 ویروس به طول 3271 جفت باز, طور کامل تعیین توالی گردید. RNA2 ایزووله طبس دارای یک ORF بوده که با AUG121 آغاز و در UAG3148 پایان یافته و پلی پروتئینی به طول 1009 آمینواسید را کد می کند. مقایسه توالی پلی پروتئین RNA2 بدست آمده با جدایه های موجود در بانک ژن نشان داد, که جدایه تعیین توالی شده دارای بیشترین درصد تشابه در سطح نوکلئوتیدی (88/45درصد) و آمینو اسیدی (90/59درصد), با جدایه ای از استرالیا (شماره دسترسی MF166754) بوده و کمترین درصد تشابه آن در سطح نوکلئوتیدی (86/82درصد) با جدایه ای از ژاپن (شماره دسترسی NC_003800) و در سطح آمینواسیدی (86/36درصد) با جدایه اسپانیا (شماره دسترسی KP223324), بود. بررسی های فیلوژنتیکی جدایه های SqMV را در دو گروه مجزا قرار داد که جدایه خراسان جنوبی-طبس درکنار جدایه هایی از چین (EU 421060), آریزونا (AF059532) و اسپانیا در یک زیرگروه قرار گرفت که نشان دهنده قرابت این جدایه ها با یکدیگر است.

استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    APA: کپی

    گرامی نوقانی، محدثه، مهرور، محسن، و زکی عقل، محمد. (1398). تعیین توالی کامل RNA2 یک جدایه از ویروس موزاییک کدو (SqMV) از استان خراسان جنوبی در ایران. (حفاظت گیاهان) پژوهش های حفاظت گیاهان ایران، 33(2 )، 135-141. SID. https://sid.ir/paper/406521/fa

    Vancouver: کپی

    گرامی نوقانی محدثه، مهرور محسن، زکی عقل محمد. تعیین توالی کامل RNA2 یک جدایه از ویروس موزاییک کدو (SqMV) از استان خراسان جنوبی در ایران. (حفاظت گیاهان) پژوهش های حفاظت گیاهان ایران[Internet]. 1398؛33(2 ):135-141. Available from: https://sid.ir/paper/406521/fa

    IEEE: کپی

    محدثه گرامی نوقانی، محسن مهرور، و محمد زکی عقل، “تعیین توالی کامل RNA2 یک جدایه از ویروس موزاییک کدو (SqMV) از استان خراسان جنوبی در ایران،” (حفاظت گیاهان) پژوهش های حفاظت گیاهان ایران، vol. 33، no. 2 ، pp. 135–141، 1398، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/406521/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی





    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button