مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

1,168
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

665
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

طبقه بندی و آنالیز شباهتی پایگاه مولکولی Binding-DB: بررسی کاربرد مدل های طبقه بندی چند منظوره برای استخراج قوانین تجمعی عمومی از پایگاه های بزرگ مولکولی

صفحات

 صفحه شروع 400 | صفحه پایان 405

چکیده

 مقدمه: در این مطالعه, با استفاده از ترکیبی از روش های کاهش بعد داده و طبقه بندی, ویژگی های مواد دارویی مورد بررسی قرار گرفت. تعریف و آماده سازی مولکول های «غیر فعال» برای توسعه مدل های تفکیکی دوتایی (Two-class classifier) یکی از مشکلات عمده در مسیر استفاده از مدل های تفکیکی بر پایه لیگاند در روند طراحی سیستماتیک دارو می باشد. از این رو, با استفاده از مولکول های «فعال» موجود در پایگاه Binding-DB, به توسعه مدل های تفکیکی چند متغیره چند منظوره پرداخته شد.روش ها: به این منظور, در حدود 160372 ریز مولکول برای 45 هدف دارویی مختلف از پایگاه مولکولی Binding-DB دانلود شد و پس از بهینه سازی ساختار, 1497 ویژگی فیزیکی و شیمیایی برای هر مولکول استخراج گردید. با استفاده از الگوریتم Apriori و ترکیب آن با روش طبقه بندی تفکیکی خطی (Linear discriminant analysis), ویژگی های مولکولی برای هر هدف دارویی به منظور تفکیک مولکول های فعال استخراج شد.یافته ها: در نهایت, با استفاده از غربالگری مجازی در پایگاه داده های مولکولی Zinc و Binding-DB و محاسبه سطح زیر نمودار Receiver operating characteristic( ROC) صحت و حساسیت طبقه بندی مورد بررسی قرار گرفت. میزان سطح زیر نمودار ROC برای هر بهینه سازی پایگاه Zinc به طور میانگین برابر با 0.8341±0.1495 و در پایگاه Binding-DB به طور میانگین برابر با 0.8615±0.1502 بود.نتیجه گیری: می توان با استفاده از الگوریتم ارایه شده, ویژگی هایی برای هر دسته از ریز مولکول های مرتبط با هر هدف دارویی استخراج کرد و پایگاه های مولکولی مختلف را برای هر هدف دارویی بهینه سازی کرد. سطح زیر نمودار ROC برای دو پایگاه مولکولی مورد بررسی نشان می دهد که روش ارایه شده, روش مفیدی برای طبقه بندی پایگاه های بزرگ مولکولی بدون استفاده از ریز مولکول های غیر فعال می باشد.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

    استناددهی

    APA: کپی

    مختاری، مرضیه، و مانی ورنوسفادرانی، احمد. (1396). طبقه بندی و آنالیز شباهتی پایگاه مولکولی Binding-DB: بررسی کاربرد مدل های طبقه بندی چند منظوره برای استخراج قوانین تجمعی عمومی از پایگاه های بزرگ مولکولی. مجله دانشکده پزشکی اصفهان، 35(426)، 400-405. SID. https://sid.ir/paper/50535/fa

    Vancouver: کپی

    مختاری مرضیه، مانی ورنوسفادرانی احمد. طبقه بندی و آنالیز شباهتی پایگاه مولکولی Binding-DB: بررسی کاربرد مدل های طبقه بندی چند منظوره برای استخراج قوانین تجمعی عمومی از پایگاه های بزرگ مولکولی. مجله دانشکده پزشکی اصفهان[Internet]. 1396؛35(426):400-405. Available from: https://sid.ir/paper/50535/fa

    IEEE: کپی

    مرضیه مختاری، و احمد مانی ورنوسفادرانی، “طبقه بندی و آنالیز شباهتی پایگاه مولکولی Binding-DB: بررسی کاربرد مدل های طبقه بندی چند منظوره برای استخراج قوانین تجمعی عمومی از پایگاه های بزرگ مولکولی،” مجله دانشکده پزشکی اصفهان، vol. 35، no. 426، pp. 400–405، 1396، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/50535/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button