مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

335
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

164
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

توالی یابی de novo ترانسکریپتوم و آنالیز عملکردی ژن های با بیان متفاوت بذرهای بزرگ و کوچک گیاه توق خاردار (Xanthium strumarium L. ) در دوره نمو

صفحات

 صفحه شروع 211 | صفحه پایان 227

چکیده

 گیاه توق خاردار (Xanthium strumarium L. ) گیاهی هرز با ارزش دارویی بالا است که به دلیل وجود خواب عمیق فقط در یکی از دو بذر درون یک کپسول این گیاه, برای مطالعات خواب بذر بسیار مورد علاقه پژوهشگران است. با این وجود, نبود اطلاعات ژنومیک در این گیاه, سبب شده است که دانسته ها در مورد آن در سطح بسیار پایینی باشد. در این تحقیق, ترانسکریپتوم بذرهای کوچک و بزرگ این گیاه در طول دوره نمو با استفاده از پلتفرم Illumina, با هدف شناسایی و بررسی عملکردی رونوشت های با بیان متفاوت میان دو بذر, توالی یابی شد. توالی های شناسایی شده بین دو بذر با یکدیگر مقایسه شدند و رونوشت های با بیان متفاوت بین دو بذر مورد تفسیر عملکردی قرار گرفتند. در این پژوهش تعداد 191192 توالی ژن با میانگین طول 69/989 جفت باز شناسایی شد. آنالیزهای تشابه توالی و تفسیر عملکردی این توالی ها برعلیه پایگاه داده nr, آنالیز GO و KEGG انجام شد. ژن های با بیان متفاوت, از نظر top hits, بیشترین تشابه را با آفتابگردان زراعی (41/83 درصد) داشتند. آنالیز GO سبب شناسایی 615 تفسیر عملکردی در 36 گروه شد. فراوان ترین GO یافت شده در دسته فرایند بیولوژیک, فرایندهای بیوسنتزی بود. نتایج این تحقیق فرایندهای بیوسنتزی و متابولیک بیشتر را در بذر بزرگ نسبت به بذر کوچک تر و نقش تنظیمی کلیدی رونویسی را در دوره نمو بذر نشان داد.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    نعمتی، ایمان، صدقی، محمد، حسینی سالکده، قاسم، توکل افشاری، رضا، و نقوی، محمدرضا. (1398). توالی یابی de novo ترانسکریپتوم و آنالیز عملکردی ژن های با بیان متفاوت بذرهای بزرگ و کوچک گیاه توق خاردار (Xanthium strumarium L. ) در دوره نمو. علوم و فناوری بذر ایران، 8(2 )، 211-227. SID. https://sid.ir/paper/525385/fa

    Vancouver: کپی

    نعمتی ایمان، صدقی محمد، حسینی سالکده قاسم، توکل افشاری رضا، نقوی محمدرضا. توالی یابی de novo ترانسکریپتوم و آنالیز عملکردی ژن های با بیان متفاوت بذرهای بزرگ و کوچک گیاه توق خاردار (Xanthium strumarium L. ) در دوره نمو. علوم و فناوری بذر ایران[Internet]. 1398؛8(2 ):211-227. Available from: https://sid.ir/paper/525385/fa

    IEEE: کپی

    ایمان نعمتی، محمد صدقی، قاسم حسینی سالکده، رضا توکل افشاری، و محمدرضا نقوی، “توالی یابی de novo ترانسکریپتوم و آنالیز عملکردی ژن های با بیان متفاوت بذرهای بزرگ و کوچک گیاه توق خاردار (Xanthium strumarium L. ) در دوره نمو،” علوم و فناوری بذر ایران، vol. 8، no. 2 ، pp. 211–227، 1398، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/525385/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button