مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

196
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

505
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

پیش بینی اپی توپ های انتی ژن های omp25 و BLS باکتری بروسلا و برهمکنش آن ها با مولکولهای MHC در گوسفند به روش بیوانفورماتیکی

صفحات

 صفحه شروع 19 | صفحه پایان 34

چکیده

 هدف: بیماری بروسلوز یک بیماری مشترک بین انسان و دام بوده که در سال های اخیر خسارت های زیادی را به صنعت دامپروری وارد کرده است. یکی از راه های پیشگیری این بیماری تهیه واکسن است. برای تولید یک واکسن نوترکیب موفق عواملی از جمله, انتخاب یک آنتی ژن مناسب از اهمیت بالایی برخوردار می باشند. بدین منظور, اخیرا در تحقیقات بالینی, زیست پزشکی و تولید واکسن های نوترکیب از اپی توپ ها در به طور گسترده ای استفاده می شود. پروتئین های سطحی این باکتری از جمله پروتئین های BLS و OMP25, دارای ویژگی های آنتی ژنیک بوده و نقش مهمی در ایجاد این بیماری بازی میکنند. با توجه به عدم وجود واکسن های موثر, امروزه نیاز به تولید واکسن های جدید و کارآمد بیش از پیش احساس می شود. هدف از این مطالعه, پیش بینی بیوانفورماتیکی اپی توپ های ژن های BLS و Omp25 باکتری بروسلا به منظور معرفی کاندید مناسب برای تولید واکسن بود. مواد و روش ها: بدین منظور, جهت پیش بینی اپی توپ ها, از سرور های SYFFPEITHI, PROPRED و IEDB استفاده شد. سپس ساختار سه بعدی به دست آمد., سپس مدلسازی اپی توپ های پیش بینی شده با استفاده از سرور Pepfold 3 انجام شد. به منظور بررسی پایداری ساختارهای پیش بینی شده و اطمینان از صحت ساختار سوم پپیتیدها, شبیه سازی دینامیک مولکولی با استفاده از نرم افزار GROMACS ورژن 2019 و در مدت زمان 10 نانوثانیه انجام شد. به منظور بررسی پایداری کمپلکس ها, بر اساس نتایج به دست آمده از داکینگ مولکولی, کمپلکس های با مقادیر منفی تر انرژی آزاد اتصال, جهت انجام شبیه سازی دینامیک مولکولی انتخاب شدند. در نهایت نتایج به دست آمده, در شرایط دینامیکی در نرم افزار گرومکس مورد بررسی قرار گرفت. بررسی استاتیک برهمکنش بین اپی توپ ها با مولکول های MHC II و MHC I گوسفندی به کمک نرم افزار Autodock vina انجام شد. نتایج: از بین نتایج به دست آمده از سرورهای مختلف, اپی توپ هایی انتخاب شده اند که در بین نتایج همه سرورها مشترک و دارای بهترین پارامترها بودند. در نهایت, 8 پپتید که عددهای بهتری داشتند به عنوان اپی توپ های پیشنهادی در نظر گرفته شدند. نتایج به دست آمده از دینامیک مولکولی نشان داد که مقادیر rmsd برای اینترلوکین و اینترلوکین متصل به پلی اپی توپ در دو حالت تفاوت زیادی نداشته, لذا این نتایج بیانگر این موضوع است که فعالیت اینترلوکین متصل به پلی اپی توپ تغییر نمی یابد. مقادیر rmsf هم نشانگر پایداری یکسان در هر دو پروتئین می باشد. در نهایت نتایج این مطالعه نشان داد که در شرایط دینامیکی, 4 اپی توپ پیش بینی شده, دارای قدرت اتصال بالا به گیرنده های MHC کلاس 1 و 2 می باشند. نتیجه گیری: علاوه بر این نتایج داکینگ و دینامیک مولکولی نشان داد که پلی اپی توپ پیش بینی شده در این مطالعه, می تواند به عنوان یک پلی اپی توپ کاندید در طراحی واکسن نوترکیب بر علیه بیماری بروسلوز مورد استفاده قرار گیرد. هرچند که برای تایید این نتایج, نیاز به انجام مطالعات تکمیلی و آزمایشگاهی می باشد.

استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    APA: کپی

    هنرحدادان، هاشم، طهمورث پور، مجتبی، و سخاوتی، محمدهادی. (1400). پیش بینی اپی توپ های انتی ژن های omp25 و BLS باکتری بروسلا و برهمکنش آن ها با مولکولهای MHC در گوسفند به روش بیوانفورماتیکی. مجله بیوتکنولوژی کشاورزی، 13(4 )، 19-34. SID. https://sid.ir/paper/957223/fa

    Vancouver: کپی

    هنرحدادان هاشم، طهمورث پور مجتبی، سخاوتی محمدهادی. پیش بینی اپی توپ های انتی ژن های omp25 و BLS باکتری بروسلا و برهمکنش آن ها با مولکولهای MHC در گوسفند به روش بیوانفورماتیکی. مجله بیوتکنولوژی کشاورزی[Internet]. 1400؛13(4 ):19-34. Available from: https://sid.ir/paper/957223/fa

    IEEE: کپی

    هاشم هنرحدادان، مجتبی طهمورث پور، و محمدهادی سخاوتی، “پیش بینی اپی توپ های انتی ژن های omp25 و BLS باکتری بروسلا و برهمکنش آن ها با مولکولهای MHC در گوسفند به روش بیوانفورماتیکی،” مجله بیوتکنولوژی کشاورزی، vol. 13، no. 4 ، pp. 19–34، 1400، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/957223/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.

    • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button