فیلترها/جستجو در نتایج    

فیلترها

سال

بانک‌ها



گروه تخصصی





متن کامل


اطلاعات دوره: 
  • سال: 

    1392
  • دوره: 

    5
  • شماره: 

    3
  • صفحات: 

    119-142
تعامل: 
  • استنادات: 

    0
  • بازدید: 

    993
  • دانلود: 

    245
چکیده: 

لطفا برای مشاهده چکیده به متن کامل (PDF) مراجعه فرمایید.

شاخص‌های تعامل:   مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید 993

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesدانلود 245 مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesاستناد 0 مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesمرجع 0
نویسندگان: 

نشریه: 

EMBO REPORTS

اطلاعات دوره: 
  • سال: 

    2022
  • دوره: 

    23
  • شماره: 

    9
  • صفحات: 

    0-0
تعامل: 
  • استنادات: 

    1
  • بازدید: 

    6
  • دانلود: 

    0
کلیدواژه: 
چکیده: 

شاخص‌های تعامل:   مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید 6

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesدانلود 0 مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesاستناد 1 مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesمرجع 0
اطلاعات دوره: 
  • سال: 

    2015
  • دوره: 

    1
تعامل: 
  • بازدید: 

    173
  • دانلود: 

    0
چکیده: 

BACKGROUND/OBJECT: BORIS/CTCFL IS AN 11 ZINC FINGER (ZF) PROTEIN, WHICH IS THE PARALOG OF CTCF, A UBIQUITOUSLY EXPRESSED PROTEIN WITH DIVERSE ROLES IN GENE EXPRESSION AND CHROMATIN ORGANIZATION. SEVERAL STUDIES HAVE SHOWN THAT EXPRESSION OF BORIS IS RESTRICTED TO NORMAL ADULT TESTIS, PLURIPOTENT AND DIVERSE CANCER CELLS. THUS, IT IS KNOWN AS A CANCER-TESTIS (CT) GENE THAT HAS BEEN HYPOTHESIZED TO EXHIBIT ONCOGENIC PROPERTIES AND PROBABLY INVOLVE IN CANCER CELL PROLIFERATION. ON THE CONTRARY, OTHERS REPORTS HAVE SHOWN THAT ITS EXPRESSION IS MORE WIDESPREAD AND CAN BE DETECTED IN DIFFERENTIATED AND NORMAL SOMATIC CELLS; HENCE, IT MIGHT HAVE ROLES IN GENERAL CELLULAR FUNCTIONS. IN THE PRESENT STUDY, IN ORDER TO EXAMINE THESE CONTRADICTORY IDEAS...

شاخص‌های تعامل:   مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید 173

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesدانلود 0
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources
اطلاعات دوره: 
  • سال: 

    1397
  • دوره: 

    31
  • شماره: 

    3
  • صفحات: 

    342-352
تعامل: 
  • استنادات: 

    0
  • بازدید: 

    646
  • دانلود: 

    213
چکیده: 

سیستم کمپلمان از اجزاء اصلی سیستم دفاعی بدن بسیاری از موجودات میباشد. وجود این سیستم در موجودات متعددی تایید شده است اما در مورد مکانیسم های تنظیم بیان آن در سطح ژنومی برخی از موجودات اطلاعاتی وجود ندارد. در این مطالعه به بررسی ناحیه بالادستی ژن C3 از ماهی قزل آلا پرداخته ایم. بافتهای مختلف ماهی تهیه و DNA با روش تغییر یافته فنل-کلروفرم استخراج شد. به کمک پرایمرهای دجنره طراحی شده برای ناحیه بالادستی این ژن که بر اساس اطلاعات سایر گونه ها انجام شد، با واکنش زنجیره پلیمراز غیر کلاسیک، قطعه هدف تکثیر و تعیین توالی و در نهایت در بانک اطلاعات ژنومی ثبت شد. در مرحله بعد به کمک سرورها و نرم افزارهای مختلف آناتومی کامل توالی بدست آمده از نظر وجود عناصر تنظیمی بررسی گردید. توالی ناحیه پروموتوری ژن C3 ماهی قزل آلا در بانک ژنومی NCBI با شماره دستیابی JQ799884. 1 به ثبت رسید. وجود توالیهای حفاظت شده جعبه TATA و همچنین عناصر پاسخگو به فاکتورهایی مانند abaA، C/EBP، CTCF، IL-6، GR و PPAR ردگیری شد، هرچند وجود نواحی پاسخگو مانند Sp1، CRE، ERE تایید نشد. نتایج این مطالعه علاوه بر تایید وجود سیستم نسبتا تکامل یافته ای از تنظیم روی سیستم کمپلمان در ماهی های استخوانی میتواند از قدیمی بودن این سیستم حمایت نماید. این مطالعه اولین گزارش دقیق از عناصر تنظیمی کنترل کننده بیان ژنی از سیستم کمپلمان است و شاید موید نقشهای جدیدی مانند دخالت مشتقات کمپلمان در تکوین اولیه جنین باشد که در مطالعاتی مطرح شده است.

شاخص‌های تعامل:   مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید 646

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesدانلود 213 مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesاستناد 0 مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesمرجع 0
اطلاعات دوره: 
  • سال: 

    1401
  • دوره: 

    30
  • شماره: 

    4
  • صفحات: 

    106-116
تعامل: 
  • استنادات: 

    0
  • بازدید: 

    82
  • دانلود: 

    33
چکیده: 

مقدمه: سندروم تخمدان پلی کیستیک (Polycystic ovary syndrome: PCOS) علت 75 درصد ناباروری های ناشی از نداشتن تخمک گذاری است. مطالعه حاضر با هدف بررسی ارتباط احتمالی میان پلی مورفیسم های اگزون 1 ژن NOEY2 در زنان مبتلا به PCOS و دیابت انجام شده است. مواد و روش ها: در این مقاله، تعداد 240 نمونه خون زنان (هرکدام به میزان cc1) شامل چهار گروه پلی کیستیک، دیابت، پلی کیستیک-دیابت و کنترل مطالعه شدند. استخراج DNA ژنومیک افراد توسط کیت استخراج و بر اساس دستورالعمل صورت گرفت. یک جفت پرایمر برای توالی اگزون 1 ژن NOEY2 طراحی و سنتز گردید. پس از انجام مراحل تکثیر ژن توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) و بررسی کیفیت باندها، توالی یابی سانگر روی محصولات PCR صورت گرفت. نتایج توالی یابی توسط نرم افزارهای Chromas، GeneRunner و Alignment و محاسبات آماری توسط نرم افزارهای SNPAlyze، SPSS و Web-Assotest بررسی و محاسبه شدند. یافته ها: تحلیل توالی ها وجود دو پلی مورفیسم را تایید کرد: پلی مورفیسم 5’, UTR c. 156G>A در ناحیه اگزون 1 ژن NOEY2 و پلی مورفیسم دوم 5’, UTR c. 156G>A، 76 نوکلیوتید دورتر از اگزون 1 و در ناحیه اینترون 1 ژن. NOEY2 پس از بررسی های آماری، اختلاف معنی داری از نظر آماری میان 5’, UTR c. 156G>A و استعداد ابتلا به PCOS و دیابت مشاهده گردید. بحث و نتیجه گیری: با توجه به نبود گزارش این ناحیه در پایگاه های داده ژنتیکی، این پلی مورفیسم اولین بار در مطالعه حاضر گزارش شده است و مطالعات بیوانفورماتیکی نشان داد که این پلی مورفیسم به سبب قرارگیری در ناحیه پروموتری همپوشان با CTCF می تواند تمایل اتصال عامل های رونویسی خاصی را با تغییر آللی تحت تاثیر قرار دهد.

شاخص‌های تعامل:   مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید 82

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesدانلود 33 مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesاستناد 0 مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesمرجع 2
اطلاعات دوره: 
  • سال: 

    2025
  • دوره: 

    20
  • شماره: 

    4
  • صفحات: 

    478-488
تعامل: 
  • استنادات: 

    0
  • بازدید: 

    0
  • دانلود: 

    0
چکیده: 

Background & Objective: Luminal B breast cancer (LBBC) is on the rise worldwide, with both incidence and mortality rates steadily increasing. Early detection proves difficult due to its aggressive characteristics, most notably its heightened proliferation rate and the complex interplay of molecular biomarkers, particularly in more advanced stages.Methods: Data Sources: In the present study, we conducted an in-silico analysis of LBBC cell lines using the Gene Expression Omnibus (GEO) microarray dataset, which includes 30 LBBC and 11 normal samples. Analysis Tools: Differentially expressed genes (DEGs) were identified using RStudio. A series of analyses, including cancer data interrogation via pan-cancer analysis, eXpression2Kinases (X2K), and the Cancer Dependency Map (DepMAP), was carried out to elucidate the underlying signaling pathways, transcription factors (TFs), and kinases, as well as to perform stemformatics analysis. Protein–protein interaction (PPI) networks were reconstructed using STRING and Cytoscape, enabling the identification of co-expressed and hub genes through the cytoHubba plug-in.Results: Of note, FGF2, EGFR, ADIPOQ, LIPE, MET, IGF1, FGF1, EGF, FGF7, and PPARG were identified as the top 10 hub genes; RELA, PPARG, CTCF, EGR1, and NFE2L2 were detected as predominant TFs in LBBC; and CDK1, CDK2, MAPK3, CSNK2A1, and MAPK14 were identified as potential biomarkers through hub gene clustering. Further analysis indicated hsa-mir-221-3p and hsa-mir-29a-3p as key miRNAs targeting LBBC-related genes.Conclusion: Collectively, our findings highlighted LBBC-associated genes, TFs, miRNAs, and pathways as prospective biomarkers, providing insights into LBBC diagnosis and therapeutic approaches.

شاخص‌های تعامل:   مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید 0

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesدانلود 0 مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesاستناد 0 مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesمرجع 0
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources
اطلاعات دوره: 
  • سال: 

    1403
  • دوره: 

    15
  • شماره: 

    2
  • صفحات: 

    1-10
تعامل: 
  • استنادات: 

    0
  • بازدید: 

    34
  • دانلود: 

    0
چکیده: 

1چکیده مبسوط مقدمه و هدف: در سرتاسر جهان، آلودگی نماتدهای دستگاه گوارش، جمله جدی‎ترین علل بیماری در نشخوارکنندگان اهلی محسوب می‎شوند. در این راستا، تنوع فنوتیپی قابل‎توجهی در داخل و بین نژادهای گوسفند نسبت به مقاومت به نماتدهای گوارشی گزارش شده است که به‎نظر می‎رسد زمینه ژنتیکی دارد. لیست ژن های کاندیدای مؤثر و شبکه ژنی شناسایی شده در خصوص مقاومت انگلی در گوسفند نشان می دهد که ژن هایی دخیل در سیستم ایمنی همچون، ژن اینترفرون interferon γ (IFN-γ) می باشد. در مسیرهای بیوشیمیایی سیتوکنین سیستم ایمنی و ایجاد مقاومت به انگل و واکنش های ایمنی نقش دارد. همچنین، بعضی جهش های موجود روی این ژن تأثیر منفی روی عملکرد سلول های تخصصی سیستم ایمنی در مواجه با انگل های مهاجم دارد. فن آوری ریز آرایهDNA، یکی از پرکاربردترین روش های پربرونداد اطلاعات مربوط به بیان ژن در پروژه های عملکرد ژنوم است که امکان بررسی بیان همزمان هزاران ژن را فراهم می کند. فن آوری ریزآرایه، ریزآرایه ژنومیکس و ریزآرایه پروتئومیکس را شامل می شود. هدف از پژوهش حاضر، شناسایی و دسته‎بندی برخی از ژن های مؤثر در مقاومت نسبی ژنتیکی گوسفند به آلودگی نماتد با استفاده از داده های ریزآرایه می باشد. مواد و روش ها: در پژوهش حاضر، جهت دستیابی به پایگاه‎های با دسترسی آزاد، بانک برخط GEO متعلق به NCBI بررسی گردید و داده های ریزآرایه مناسب با بهترین تکرار برای آلودگی به نماتدهای انگلی دانلود (پلتفورم GPL4077، GPL4076 و GPL4072 با مجموع 48 داده خام) و با استفاده از بسته های نرم افزاری مبتنی بر R مورد بررسی قرار گرفت و ژن های با بیان افتراقی معنی‎دار شناسایی شدند. این داده ­ها، به سه دسته‎ی شاهد، قبل از عفونت و سلول‎های عفونی تقسیم‎بندی شدند. به‎منظور، بررسی کیفیت داده ها از سه نمودار مرجع Heatmap، تجزیه مولفه‎های واریانس (PCA) و نمودار آتشفشانی استفاده گردید. سپس، با بررسی این نمودار ها نمونه هایی که دارای کیفیت نامطلوب بودند از مراحل بعدی تجزیه و تحلیل حذف گردید. از پکیج نرم‎افزاری تحت مجموعه R/Bioconductor و وابستگی‎های نرم‎افزاری آنها همچون (Biobase، GEOquery، limma، affy، Genfilter، Pheatmap، Plyr، Reshape2، (Ggplot2 برای مشخص شدن افزایش و یا کاهش معنی‎دار بیان ژن‎ها و تفکیک آنها از ژن‎های اولیه استفاده شد. داده‎های خام در مقیاس لگاریتمی سنجیده شد و همچنین، از آماره P value تصحیح شده در جهت مقایسات بیان بین گروه های ژنی استفاده گردید. یافته ها: نتایج مشاهده شده در خصوص کنترل کیفیت داده‎های خام و خروجی‎های مربوط به کنترل کیفیت داده‎های ادغام شده نشان داد که واریانس درون‎گروهی داده‎های خام بالا بوده فلذا، پیش تصحیح و پردازش داده‎های خام در این خصوص قبل از تجزیه و تحلیل اصلی انجام شد. نتایج آنالیز همبستگی پس از پیش پردازش داده‎های خام بیانگر ارتباط قوی ژن‎ها در گروه‎های آلوده (inf) و پیش‎آلوده ((pre-inf در مقایسه با نمونه‎ی سالم که به‎عنوان کنترل استفاده شد بود که اعتبارسنجی نتایج آتی را بطور قوی تایید کرد. پس از انجام آنالیزهای بیوانفورماتیکی، ژن‎های کاندیدای NACA، RPL4،NAGS ، CTCF، GBP1، BHLHE، YTHDF3، PDHA1، MXI1 دچار افزایش بیان معنی‎دار و ژن‎های PDHA1 و MXI1 دچار کاهش بیان معنی‎دار شدند. با توجه به نتایج به‎دست آمده در این مطالعه، این ژن‎ها از دیدگاه آنتولوژی، در روند متابولیسم سلولی، عملکرد مولکولی، ایجاد ترکیبات ژنتیکی و زندگی سلولی نقش دارند. بنابراین، با مشاهده به سطح p-value <0.05 به‎عنوان ژن‎های معنادار گزارش شدند. ژن NAGS در واقع ژن ان اکریل گلوتامات سنتتاز می‎باشد که کوفاکتور اولین انزیم دخیل در سیکل دفع اوره در پستانداران می‎باشد نقش عملکردی این ژن در بسیاری از بیماری‎های عصبی مشخص شده است. ژن CTCF تاثیر مثبت بر روی سلول‎های سیستم ایمنی می‎گذارد و مخصوصاً در مقابله با ویروس‎ها و عوامل مهاجم به بدن میزبان ایفای نقش می‎کند. ژن گوانیلات بایدنیگ پروتئینGBP1  در مقابله بدن با بسیاری از عوامل عفونی نقش دارد. این ژن باعث پاسخ‎های اکسی داتیو و اتوفاژی سیستم ایمنی میزبان در برایر عوامل مهاجم می‎گردد. ژن متیل آدونوزین ار ان ای بابدینگ 3 کارایی بیشتری در ایمنی آنتی‎ویرال داشته و همچنین ارتباط نزدیکی با ژن گوانیلات بایدنیگ پروتئین که در مقابله بدن با بسیاری از عوامل عفونی نقش دارد. این ژن باعث پاسخ‎های اکسی داتیو و اتوفاژی سیستم ایمنی میزبان در برابر عوامل مهاجم می‎گردد. ژن پیروات دهیدروژناز PDHA1 در متابولیسم سیستم‎های ایمنی نقش دارد. این ژن در تنظیمات ناشی از فاکتورهای آلوستریک، ترمیم پیوندهای کووالانسی و تغییرات نسبتاً سریع در مقادیر پروتئین های بیان شده، یا با تغییر بیان ژن یا تخریب پروتئولیتیک نقش آفرینی می‎کند. ژن MXI1 برای کنترل ورود عوامل مهاجم به داخل بدن میزبان کمک می‎کند و باعث بهبود و التیام عفونت‎ها می‎شود.علت توجیهی عدم تطبیق نتایج پژوهش حاضر با مطالعات پیشین را می‎توان به عواملی همچون استفاده از نمونه‎ها (نژادهای متفاوت) و تکنیک‎های آزمایشگاهی متفاوت، میزان آلودگی با انگل متفاوت، سن متفاوت ماده آزمایشی، نوع و تیپ متفاوت نماتد، تکنیک و ابزار متفاوت، تفاوت‎های آب و هوایی منطقه آزمایش و موقعیت جغرافیایی و استفاده از تکنیک‎های متفاوت ار ان سیک و میکرواری را دانست. با این وجود نتایج و خروجی‎های این مطالعه در شرایط حاکم مربوطه می‎تواند کاربردی باشد. نتیجه گیری: استفاده از اطلاعات و خروجی‎های تکنیک میکرواری و بررسی الگوی بیان افتراقی می‎تواند برای اصلاح دام مولکولی گوسفند در جهت مقاومت به انگل‎های داخلی از طریق تلفیق اطلاعات فنوتیپی و ژنوتیپی در مدل‎های حیوانی کمک شایان توجهی نماید.

شاخص‌های تعامل:   مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید 34

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesدانلود 0 مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesاستناد 0 مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resourcesمرجع 0
litScript
telegram sharing button
whatsapp sharing button
linkedin sharing button
twitter sharing button
email sharing button
email sharing button
email sharing button
sharethis sharing button