رتروترانسپوزون ها یا ترانسپوزون هایی که بواسطه یک RNA حدواسط منتقل می گردند. شامل آن دسته از عناصر متحرک می باشند که ابتدا از روی توالی DNA آنها RNA ساخته شده و سپس به کمک آنزیم رونوشت بردار معکوس از روی RNA، DNA قابل انتقال به مکان جدید بدست می آید. این عناصر ژنتیکی متحرک به مقدار بسیار زیادی در ژنوم گیاهان وجود دارند و نقش مهمی را در تکامل ژنوم گیاهان بازی می کنند، مثلا در گندم نان، 90 درصد ژنوم آن از رتروترانسپوزون ها می باشد و همچنین در ژنوم ذرت این مقدار بین 80- 50 درصد است. بعضی عقیده دارند که رتروترانسپوزونها از زمان شروع تبدیل ژنوم های انواع RNA به DNA منشا گرفته اند. فراوانی رتروترانسپوزونها و هتروژن بودن بسیاری از توالی های آنها نشان می دهد که آنها در گیاهان اولیه حضور داشته اند و یا ممکن است که رتروترانسپوزونها بعد از تشکیل اولین سلول یوکاریوتی بوجود آمده باشند و از طریق انتقال افقی و عمودی در بین موجودات پراکنده شده باشند.