به منظور شناسایی، تراکم و پراکنش زئوپلانکتون ها و تغییرات آنها طی 3 مرحله نمونه برداری از زمستان 1388 الی تابستان 1389 انجام پذیرفت. نمونه برداری توسط تور کمرشکن 55 میکرون (Judy Net) انجام، سپس توسط فرمالین به نسبت 4 درصد تثبیت و در آزمایشگاه با میکروسکوپ معکوس مطالعه شدند. در این بررسی به طورکلی 6 شاخه زئوپلانکتونی در 31 جنس شناسایی شدند. در این بین از زیر سلسله Protozoa و شاخه های Rhizopoda 5 جنس و Ciliophora 2 جنس، از شاخه Gastrotricha یک جنس و شاخه Nematoda، 20 جنس مربوط به شاخة Rotatoria و از شاخة Arthropoda (بندپایان) و راسته Cladocera دو جنس بهمراه مرحله جنینی و از رده Copepoda یک جنس به همراه مرحلة ناپلی آنها و خانواده Chironomidae مشاهده گردید. در ترکیب جامعة زئوپلانکتونی دریاچه ارسباران بیشترین تنوع مربوط به شاخة Rotatoria با جنس های PolyarthraSynchaeta, Brachionus, Keratella, و Trichocerca و بیشترین تنوع و فراوانی این شاخه مربوط به فصل بهار بوده است. در مجموع شاخه روتاتوریا با میانگین 1179 عدد در لیتر و فراوانی 69 درصد بیشترین جمعیت زئوپلانکتونی را در این دریاچه دارا بوده است. فراوانی زئوپلانکتون ها در بین ایستگاه ها و ماه های مختلف اختلاف معنی دار آماری وجود داشت (05/0P<). در بررسی فصول نیز فصل تابستان با دو فصل دیگر این اختلاف معنی دار را نشان داد (05/0P<). مطالعات بیولوژیک نشان داد که پتانسیل تولید پلانکتونی شاخه گردانتنان در این دریاچه در حد تقریباً بالایی می باشد.