کویر میقان منطقه ای است که در فاصله 15 کیلومتری شمال شرق اراک قرار دارد. در این تحقیق تنوع گونه ای به عنوان یکی از مهمترین پارامترهای نشان دهنده تغییرات در اکوسیستم ها با استفاده از نرم افزار Diver و Nucosa و بر اساس شاخص ها و مدل های مختلف تنوع گونه ای شامل Logaritmic, Lognormal, Broken-stick و Geometric در جوامع گیاهی کویر میقان مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که جامعه Nitrarietum schoberi دارای پایین ترین تنوع گونه ای و جامعه Limonietum iranici دارای بالاترین تنوع گونه ای در بین 9 جامعه گیاهی می باشند که به ترتیب با مدل های Geometric (جوامع شکننده و بی ثبات) و Lognormal (جوامع با ثبات) منطبق شده اند. سپس داده های خاک شناسی و سطح آب زیرزمینی با استفاده از نرم افزار Statistica مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. تجزیه و تحلیل عاملی متغیرها (Factor analysis) نشان داد که از بین متغیرهای مورد مطالعه، 6 متغیر اصلی شامل هدایت الکتریکی، مقدار یون منیزیوم، میزان گچ، درصد کربن آلی و بافت خاک و همچنین سطح ایستابی با ریشه پنهان ماتریسی (Eigenvalues) برابر 76.8 درصد در تعیین نقاط اکولوژیک یکسان و تغییرات تنوع گونه ای از اهمیت بالایی برخوردار هستند.