من أهم القضایا فی علم أصول الفقه، خاصة مع ظهور القضایا الفقهیة الجدیدة، إزالة النواقص فی علم أصول الفقه بشکل یضاف إلی الاجابة عن المشاکل القدیمة، یمکنها أیضًا حل القضایا الفقهیة الجدیدة. وهذا یتطلب تغییراً فی هیکلیة علم أصول الفقه وتوسیع نطاق هذا العلم. وقد اعتمدت هذه الدراسة علی المنهج التحلیلی والمقارنة للقضایا الفقهیة وخاصة المستجدة ومن منظار تحلیلی فی علم أصول الفقه معطوفا علی الترکیب والمحتوی حسب الغرض من هذا العلم. والغایة من الدراسة تکامل العلم من حیث الهیکلیة والمحتوی ومعرفة القواعد اللازمة لحل القضایا الفقهیة وخاصة المستجدة منها. فکانت محصلة البحث هی أنّ أصول الفقه بما له من الهیکلیة المشهورة والقضایا المعروفة یتطلّب تغییر هذه الهیکلیة علی النحو التالی: 1. أن تدور حول محور (آلیة کشف الشریعة وتحصیل العذر). 2. اثراء الکثیر من القضایا المعنیة بالفقه وتسلیط الضوء علی فروعها. 3.طرح المصادر المطروحة فی أصول الفقه عند أهل السنة علی طاولة البحث، لأن انکارنا لمصدریتها لا یعنی بالضرورة الغفلة عن سائر فوائدها. 4. تبیین القضایا التی تتکرّر الافادة منها عملیاً ورفع غوامضها. 5. ومثل ما وقع الکلام باسهاب عن وظائف المتفهّم للنصّ – المتصدی للاستنباط – فی الکتاب الأوّل من أصول الفقه بحسب تعبیرنا – یجب أن یقع الکلام عن وظائف مبیّنی الشریعة فی الکتاب الثانی من أصول الفقه، وعلی فرض عدم ثبوت وظیفة لهم، یجب البحث حول الطرق التی راعاها مبیّنو الشریعة فی تبیینهم للشریعة.ثمّة قضایا لا تُعدّ ینبغی إضافتها إلی الکتاب الأوّل من أصول الفقه أوالتُدرج فی الکتاب الثالث منه حسب تعبیرنا.