خرمارود از رودخانه های شهرستان آزادشهر در استان گلستان می باشد که از ارتفاعات جنوب شرقی این شهرستان سرچشمه گرفته به رودخانه گرگانرود و در نهایت دریای خزر می ریزد. دیاتوم ها، فلور جلبکی غالب را در اکوسیستم های آبی تشکیل می دهند و به عنوان معرف های شرایط محیطی مطرح هستند. به منظور شناسایی فلور دیاتومه ای خرمارود نمونه برداری طی تابستان و پاییز 1396 از بسترهای سنگی و رسوب انجام گرفت. در این مطالعه به طور کلی تعداد 60 گونه دیاتوم متعلق به 32 جنس و 20 تیره شناسایی شد. 59 گونه متعلق به رده Bacillariophyceae و تنها 1 گونه از رده Coscinodiscophyceaبود. بزرگترین جنس Nitzschiaبا 7 گونه بود و جنس های Navicula و Gomphonema با 5 گونه رده های بعدی را به خود اختصاص دادند. بیشترین فراوانی ها مربوط به گونه های Achnanthidium gracillimum، Achnanthidium minutissimum، Cocconeis placentula، Cymbella affinis، Encyonopsis minuta، Gomphonema olivaceum و Nitzschia inconspicua بود. براساس نتایج شاخص های تنوع ایستگاه سوم که تحت تأثیر روانابهای استخر پرورش ماهی قرار داشت دارای تنوع گونه ای کمتر و در وضعیت شدیداً آلوده قرار داشت و بقیه ایستگاهها کمی آلوده بودند. همچنین در تمامی ایستگاهها نمونه های مربوط به رسوب تنوع بیشتری نسبت به بستر سنگی داشتند که می تواند اینطور توجیه شود که نمونه های رسوب نسبت به بستر سنگی کمتر از وضعیت شیمیایی آب تأثیر می پذیرند.