مطالعه ی حاضر به بیان روشی برای تخمین اثربخشی بیولوژیکی نسبی، RBE، نوترون های سریع با استفاده از شبیه سازی مونت کارلو می پردازد. این رهیافت بر اساس ترکیب یک مدل با دقت اتمی از هندسه مولکول DNA و شبیه سازی به روش مونت کارلو برای ردیابی ذرات است. موقعیت دقیق مکانی اتم های مولکول DNA از بانک داده پروتئینی استخراج گشته است. ابزار Geant4 برای ردیابی ذرات ثانویه تولید شده توسط نوترون های سریع در برهمکنش شان با آب مایع استفاده گردید. به دلیل استفاده از طیف انرژی ذرات ثانویه به جای تابش مستقیم نوترون، زمان محاسبات به طور محسوسی کاهش یافت. شکست رشته ای دوگانه به عنوان مؤثرترین نوع آسیب، برای تخمین RBE نوترون ها، استفاده شد. پرتوهای گامای کبالت 60 به عنوان تابش مرجع برای محاسبه RBE در نظر گرفته شدند. مدل در توصیف رفتار RBE و محل RBEmax بر اساس توزیع انرژی نوترون ها موفق بوده است.