ویروس کوتولگی پیسه ای بادنجان از گیاهان بادنجان آلوده در اصفهان جداسازی و به طور مکانیکی به گیاهان Nicotianna glutinosa و N. tabacum var. Turkish منتقل شد. خالص سازی پیکره کامل ویروس با همگن سازی بافت آلوده گیاهان Nicotianna glutinosaو N. tabacum var. Turkish در بافر سیترات و اسیدی کردن عصاره تا 5.4 pH ، سانتریفوژ کردن افتراقی و سانتریفوژ کردن در ستون های دارای شیب پله ای سوکروز انجام شد. خالص سازی نوکلئوکپسید ویروس با اضافه کردن Triton X-100 به میزان 2% به عصاره سانتریفوژ کردن افتراقی و سانتریفوژ کردن در ستون های دارای شیب چگالی سوکروز انجام گرفت. هم آموده کامل ویروس و هم آموده نوکلئوکپسید برای تهیه آنتی سرم به خرگوش تزریق شد. آنتی سرم تولید شده علیه پیکره کامل در مقابل عصاره گیاه آلوده تولید دو خط رسوبی مشخص کرد ولی آنتی سرم علیه نوکلئوکپسید تنها یک خطر رسوب قوی در مقابل عصاره بادنجان آلوده داشت. در الکتروفورز پروتئین در ژل پلی اکریل آمید دارای SDS ، آموده خالص شده ویروس ایجاد پنج باند مشخص کرد که در بافت سالم تحت تیمار خالص سازی قرار گرفته وجود نداشت. وزن مولکولی این باندها به ترتیب بر حسب کیلودالتون برابر 83.5-82.5 ، 63-62 ، 57، 32-31.5 و 20.5-20 بود. این پروتئین ها به ترتیب با پروتئین های M2,M1,NS,N,G در رابدر ویروس ها قابل مقایسه هستند. وزن مولکولی نوکلئیک اسید ویروس کوتولگی پیسه ای بادنجان در ژل آگار 106 x 4.028 دالتون تخمین زده شد.