مقدمه: زیر گونه های Shiga toxin– producing E. coli) STEC) و بیوتایپ 1 شیگلا دیسانتری باعث ایجاد اسهال، کولیت هموراژیک و ناهنجاری های بدخیم سیستم مجاری ادراری HUS (Hemolytic Uremic Syndrome) در انسان می شوند. بسیاری از نشانه های کلینیکی این بیماری در اثر تولید شیگا توکسین 1(Stx/Stx1)، شیگا توکسین 2 (Stx2) و یا مجموعه ای از هر دو نوع توکسین پدید می آید. این تحقیق جهت شناسایی ژن این توکسین ها به وسیله روش ملکولی صورت گرفته است.مواد و روش کار: برای شناسایی ژن های stx/stx1 و stx2 تکنیکی بر اساس Multiplex PCR به همراه ژن مالات دهیدروژناز (mdh) موجود در دو باکتری E.coli و شیگلا طراحی شده است. مجموعه ای از 6 پرایمر استفاده شده است: SFI وSRI یک قطعه bp 199 از ژن mdh را تولید می کنند که به عنوان یک کنترل مثبت (Internal positive control) برای صحت واکنش عمل می کند، Ka2R و Ka2F یک قطعه 381pb از ژن stx2 را تولید و Ka1F و Ka1R یک قطعه 622pb از ژن stx/stx1 را تولید کنند. جهت تایید محصولات واکنش از فرآیند هضم آنزیمی و تعیین توالی استفاده شد.نتایج: محصولات PCR ژن های stx/stx1 و stx2 و mdhتنها در E.coli O157:H7 به طور هم زمان مشاهده شد و در بیوتایپ 1 شیگلا دیسانتری تنها قطعه مربوط به stx/stx1و mdh مشاهده گردید. در ژنوم تخلیص شده از دیگر باکتری های گرم منفی قطعات مربوط به توکسین مشاهده نشد. فرآیند هضم آنزیمی و تعیین توالی صحت قطعات تکثیر شده را مورد تایید قرار داد. حساسیت واکنش PCR برای شناسایی ژن شیگا توکسین pg/ml 2.1 از ژنوم باکتری و معادل cfu/ml 320 بود.بحث: واکنش طراحی شده قادر به شناسایی ژن های stx2, stx/stx1 وmdh می باشد. E. coli O157:H7 قادر به تولید هر دو نوع شیگا توکسین و بیوتیپ 1 شیگلا دیسانتری تنها قادر به تولید نوع 1 شیگا توکسین می باشند. با بررسی های انجام شده بر روی قطعات تکثیر شده و مقایسه آن ها با بانک ژنوم مشخص شد که قطعه در نظر گرفته شده برای تکثیرstx2 در تمامی انواع این ژن وجود دارد، در نتیجه جهت شناسایی آن ها مناسب می باشد. این روش وسیله ای مناسب جهت تشخیص انواع شیگا توکسین ها می باشد چرا که سریع، اختصاصی، حساس و ارزان می باشد.