سوخت های فسیلی، یکی از نهاده های مهم مصرفی در بخش های تولیدی اند که در ایران با قیمت بسیار پایین تر از قیمت جهانی در اختیار تولیدکنندگان و مصرف کنندگان قرار می گیرند و سهم زیادی از یارانه پرداختی را به خود اختصاص می دهند. یارانه های انرژی با تاثیر بر هزینه و قیمت کالاها و خدمات، تغییرات پیچیده ای در اقتصاد از طریق تخصیص منابع به وجود می آورد، که دارای آثار گسترده ای می باشد.در این مقاله، یک الگوهای تعادل عمومی قابل محاسبه (CGE) تدوین و اطلاعات مربوط به آخرین جدول داده-ستانده در سال 1380 خراسان رضوی و حساب های ملی ایران در همین سال در قالب ماتریس حسابداری اجتماعی به عنوان پایه آماری به کار گرفته شده است و اثرات حذف یارانه سوخت بر تغییرات تولید، هزینه و قیمت در قالب مدل تعادل عمومی محاسباتی مورد بررسی قرار گرفته است.نتایج به دست آمده نشان می دهد با حذف یارانه سوخت های فسیلی شاخص تولید، هزینه و قیمت کالاهای تولیدی بخشهای مختلف افزایش می یابد و بالاترین رشد تولید و هزینه، مربوط به بخش گاز طبیعی و بالاترین افزایش قیمت، مربوط به بخش فرآورده های نفتی می باشد.سناریوی حذف یکباره با افزایش تولید کمتر و افزایش هزینه بیشتر نسبت به دیگر سناریوها، ترجیح داده می شود؛ زیرا پس از آزادسازی قیمت ها، بار روانی این افزایش قیمت در یک سال تحمیل می شود.