مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

896
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

544
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

تخمین مکان نواحی کدکننده پروتئین در توالی عددی DNA با استفاده پنجره با طول متغیر بر مبنای منحنی سه بعدی Z

صفحات

 صفحه شروع 63 | صفحه پایان 78

چکیده

 تخمین دقیق نواحی کدکننده پروتئین در ژن ها با استفاده از ابزارهای پردازش سیگنال, در سال های اخیر به چالشی در بیوانفورماتیک تبدیل شده است. بسیاری از روش های پردازش سیگنال های ژنومیک بر مبنای خاصیت تناوب 3 بازهای موجود در رشته های DNA متمرکز بوده و سپس تحلیل های طیفی بمنظور یافتن موقعیت مولفه های متناوب بر روی توالی های عددی DNA اعمال می شود. در این مقاله با استفاده از پنجره با طول متغیر و بر مبنای منحنی Z, الگوریتمی بمنظور تعیین نواحی کدکننده پروتئین ارائه می کنیم. منحنی Z, یک منحنی سه بعدی منحصربفرد برای نمایش توالی DNA می باشد که توصیف کاملی از رفتار بیولوژیکی توالی DNA را بدست می دهد. الگوریتم پیشنهادی بدلیل استفاده از پنجره گوسی با طول قابل تنظیم, از رزولوشن و دقت بسیار بالایی در تخمین نواحی ژنی برخوردار بوده و نواحی غیرپروتئینی در آن کاملا حذف می شود. همچنین بمنظور استخراج مولفه تناوب 3 از یک فیلتر میانگذر باند محدود با فرکانس مرکزی 2π /3 استفاده می نماییم. الگوریتم پیشنهادی ابتدا بر روی توالی F56F11. 4 در C. elegans اعمال و نتایج آن با سایر روش های موجود مقایسه شده و سپس آنرا بترتیب برروی ژن های موجود در دو پایگاه داده HMR195 و BG570 اعمال می نماییم.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    صابرکاری، حمیدرضا، شمسی، موسی، و صداقی، محمدحسین. (1395). تخمین مکان نواحی کدکننده پروتئین در توالی عددی DNA با استفاده پنجره با طول متغیر بر مبنای منحنی سه بعدی Z. پردازش علایم و داده ها، 13(4 (پیاپی 30) )، 63-78. SID. https://sid.ir/paper/160789/fa

    Vancouver: کپی

    صابرکاری حمیدرضا، شمسی موسی، صداقی محمدحسین. تخمین مکان نواحی کدکننده پروتئین در توالی عددی DNA با استفاده پنجره با طول متغیر بر مبنای منحنی سه بعدی Z. پردازش علایم و داده ها[Internet]. 1395؛13(4 (پیاپی 30) ):63-78. Available from: https://sid.ir/paper/160789/fa

    IEEE: کپی

    حمیدرضا صابرکاری، موسی شمسی، و محمدحسین صداقی، “تخمین مکان نواحی کدکننده پروتئین در توالی عددی DNA با استفاده پنجره با طول متغیر بر مبنای منحنی سه بعدی Z،” پردازش علایم و داده ها، vol. 13، no. 4 (پیاپی 30) ، pp. 63–78، 1395، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/160789/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button