مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

439
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

522
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

تأثیر اسناد کردن و تراکم نشانگری در بهبود درستی ارزیابی های ژنگانی

صفحات

 صفحه شروع 73 | صفحه پایان 81

چکیده

 با دسترسی به اطلاعات نشانگرهای تک نوکلئوتیدی (SNP ), پیش بینی شایستگی ژنتیکی افراد بدون اطلاعات پدیدگانی (فنوتیپی) با استفاده از ارزیابی ژنگانی (ژنومی) امکان پذیر شده است. لیکن, استفاده از تراشه (چیپ) های متراکم برای ارزیابی همه ی افراد جمعیت مقرون به صرفه نیست. برای دستیابی به بیشترین بازدهی در بررسی های ژنگانی می توان گروهی از حیوان ها را با تراشه های با تراکم بالا و دیگر افراد را با تراشه های کم تراکم تعیین نژادگان (ژنوتیپ) کرد, سپس آن ها را به تراکم بالا اسناد (ایمپیوت) کرد. در این بررسی, تأثیر سه تراشه ی کم تراکم (1k, 2k و 4k), اسناد شده به تراکم بالای 10k و رابطه ی خویشاوندی بین جمعیت مرجع و جمعیت های تأیید بر درستی ارزیابی ژنگانی و نیز همبستگی ارزش های اصلاحی برآورد شده در تراشه های مختلف با استفاده از داده ی همانند سازی شده, بررسی شد. برای ساختن تراشه های کم تراکم, 10, 20 و 40 درصد از نشانگرهای 10k به صورت تصادفی انتخاب شدند. اسناد کردن (ایمپیوتیشن) با استفاده از نرم افزار FImpute صورت گرفت. به طورکلی با افزایش تراکم نشانگری, همبستگی بین ارزش های اصلاحی برآورد شده به دست آمده از تراشه های مختلف افزایش پیدا کرد. به گونه ای که, درستی ارزیابی ژنگانی تراشه ی کم تراکم 4k و تراشه ی متراکم 10k همسان بودند. همچنین پس از اسناد کردن نژادگان های تراشه ی 4k به 10k, تفاوتی بین درستی ارزیابی های ژنگانی ایجاد نشد. با افزایش فاصله ی جمعیت مرجع و جمعیت های تأیید, درستی اسناد کردن کاهش یافت.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    پرنا، ناهید، نجاتی جوارمی، اردشیر، صادقی، مصطفی، و عبدالهی آرپناهی، رستم. (1397). تأثیر اسناد کردن و تراکم نشانگری در بهبود درستی ارزیابی های ژنگانی. علوم دامی ایران ( علوم کشاورزی ایران)، 49(1 )، 73-81. SID. https://sid.ir/paper/193530/fa

    Vancouver: کپی

    پرنا ناهید، نجاتی جوارمی اردشیر، صادقی مصطفی، عبدالهی آرپناهی رستم. تأثیر اسناد کردن و تراکم نشانگری در بهبود درستی ارزیابی های ژنگانی. علوم دامی ایران ( علوم کشاورزی ایران)[Internet]. 1397؛49(1 ):73-81. Available from: https://sid.ir/paper/193530/fa

    IEEE: کپی

    ناهید پرنا، اردشیر نجاتی جوارمی، مصطفی صادقی، و رستم عبدالهی آرپناهی، “تأثیر اسناد کردن و تراکم نشانگری در بهبود درستی ارزیابی های ژنگانی،” علوم دامی ایران ( علوم کشاورزی ایران)، vol. 49، no. 1 ، pp. 73–81، 1397، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/193530/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button