مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

423
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

493
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

بررسی عملکرد پروتئین های پیش بینی شده از داده های RNA-Seq در گاوهای نژاد هلشتاین و کلیستانی

صفحات

 صفحه شروع 121 | صفحه پایان 135

چکیده

 پژوهش حاضر به منظور تعیین نیم رخ بیانی عددی ژن های متفاوت بیان شده در نژادهای هلشتاین و کلیستانی و همچنین بررسی عملکرد پروتئین های پیش بینی شده از ژن های متفاوت بیان شده بین دو نژاد مذکور با استفاده از داده های RNA-Seq انجام شد. در این مطالعه توالی کل mRNA خون گاو ماده هلشتاین آمریکا و گاو ماده کلیستانی پاکستان از طریق هم ردیفی و مکان-یابی خوانش های RNA-Seq روی ژنوم مرجع گاو بدست آمد و سپس تعیین نیم رخ بیانی عددی ژن های متفاوت بیان شده انجام شد. تعداد 24616 ژن و 26716 ایزوفرم روی ترانسکریپتوم این دو نژاد شناسایی شدند که از این میان تعداد 41 ژن شناسایی شدند که تفاوت بیانی بسیار بالا و معنی داری را نشان دادند (000015p<). ً حدود یک سوم ژن هایی که عملکردشان بین دو نژاد متغیر بود, کدکننده آنزیم های هیدرولاز و پنج مورد از پروتئین های پیش بینی شده از جمله پروتئین های عامل رونویسی FosB/JunD, انکوژن FOS, ساختار elonginb, زیرواحد عامل رونویسی AP-1, کمپلکس روی zif268 و عامل تنظیمی-رونویسی U2AF هستند که در تنظیم رونویسی و بیان ژن ها و ویرایش RNA نقش دارند. بررسی میان کنش شبکه ای بین پروتئین های پیش بینی شده از ژن های متفاوت بیان شده نشان داد که پروتئین های پیش بینی شده در مسیرهای مختلفی مانند مسیر پیام دهی TNF, عفونت سالمونلایی, مسیر پیام دهی MAPK و آرتریت روماتوئید دخالت دارند. همچنین بررسی ها نشان داد نژاد هلشتاین و کلیستانی به علت قرار گرفتن در شرایط محیطی متفاوت و فاصله تکاملی, توانسته اند با شرایط پیرامونی به خوبی سازگار شوند و این روند در سطح مولکولی از میزان بیان ژن های اختصاصی شناسایی شده در این پژوهش کاملاً قابل فهم است. از دلایل تأییدکننده این پیشنهاد می توان به نقش بیشتر سامانه ی ایمنی در نژاد کلیستانی اشاره نمود که به علت قرار گرفتن در محیطی با آلودگی بالاتر در مقایسه با نژاد هلشتاین, میزان بیان پروتئین های دارای خاصیت باکتریوسایدی (Cathelicidin 1) در آن بالا رفته و در نتیجه فعالیت سامانه ی ایمنی در آن افزایش یافته است. همچنین در این پژوهش مشخص شد که ژن IL1B بیشترین درجه تعامل ژن-دارو را با داروی Canakinumab دارد. نتایج این پژوهش نشان می دهد که در مقایسه های بین نژادی, نگاه دقیق به فعالیت پروتئین هایی که توسط ژن های متفاوت بیان می شوند می توانند تفاوت نژادی در سطح ملکولی را بهتر توضیح دهند.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    قادری زفره ایی، مصطفی، ترابی، آزاده، اسماعیل پور، محمد، سلیم پور، مینا، و بنابازی، محمدحسین. (1399). بررسی عملکرد پروتئین های پیش بینی شده از داده های RNA-Seq در گاوهای نژاد هلشتاین و کلیستانی. پژوهش های تولیدات دامی، 11(28 )، 121-135. SID. https://sid.ir/paper/388864/fa

    Vancouver: کپی

    قادری زفره ایی مصطفی، ترابی آزاده، اسماعیل پور محمد، سلیم پور مینا، بنابازی محمدحسین. بررسی عملکرد پروتئین های پیش بینی شده از داده های RNA-Seq در گاوهای نژاد هلشتاین و کلیستانی. پژوهش های تولیدات دامی[Internet]. 1399؛11(28 ):121-135. Available from: https://sid.ir/paper/388864/fa

    IEEE: کپی

    مصطفی قادری زفره ایی، آزاده ترابی، محمد اسماعیل پور، مینا سلیم پور، و محمدحسین بنابازی، “بررسی عملکرد پروتئین های پیش بینی شده از داده های RNA-Seq در گاوهای نژاد هلشتاین و کلیستانی،” پژوهش های تولیدات دامی، vol. 11، no. 28 ، pp. 121–135، 1399، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/388864/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button