مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

130
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

453
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

ژنی جهت شناسایی ژن ها و مسیرهای زیستی مرتبط با صفات تجزیه و تحلیل مجموعه های وزن تخم مرغ در کل دوره تولید

صفحات

 صفحه شروع 91 | صفحه پایان 116

چکیده

 هدف: شناسایی ژن های بزرگ اثر موثر بر صفات مهم اقتصادی یکی از مهم ترین اهداف اصلاح نژادی در پرورش مرغ است. پژوهش حاضر به منظور مطالعه پویش ژنومی بر اساس آنالیز مجموعه های ژنی برای شناسایی جایگاه های ژنی موثر بر صفات مرتبط با وزن تخم مرغ نژاد رد آیلند رد با استفاده از آرایه های ژنومی با تراکم بالا بوده است. مواد و روش ها: اطلاعات رکورد های فنوتیپی و ژنوتیپی مرتبط با وزن تخم مرغ نمونه ها از پایگاه ذخیره ژنومی برخط Figshare استفاده شد. آنالیز پویش کل ژنومی بر پایه آنالیز مسیر در سه مرحله تعیین مکان SNPهای معنی دار با ژن, ارتباط ژن ها به طبقات عملکردی و مسیرهای بیوشیمیایی و پویش کل ژنومی بر پایه آنالیز مسیر انجام می شود. بر این اساس, مطالعه پویش ژنومی برای صفات وزن تخم مرغ در اولین تخم گذاری و 28, 36, 56, 66, 72 و 80 هفتگی در 1078 قطعه مرغ در برنامه GenABEL انجام شد. سپس با استفاده از بسته نرم افزاری biomaRt2 ژن های معنی داری که در داخل و یا 20 کیلوباز بالادست یا پایین دست نشانگرهای SNP معنی دار قرار داشتند, شناسایی گردید. در نهایت تفسیر مجموعه ژنی با بسته نرم افزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی عملکرد بیولوژیکی ژن های نزدیک به مناطق انتخابی و ژن های کاندیدا از طریق پایگاه های GO, KEGG, DAVID و PANTHER انجام شد. نتایج: در این پژوهش تعداد 9 نشانگر تک نوکلیوتیدی واقع روی کروموزوم های 3, 4, 6, 7, 8, 9, 19, 20 و 22 شناسایی شدند که با ژن هایMC3R, LEPR, ECT2, SH3GL2, KCNMA1, SPP1, PCK1, MMP9, PPP1CB, ACOX1 و IGFBP2 مرتبط بودند. تعدادی از این نشانگرهای شناسایی شده در مناطق ژنومی معنی دار با مطالعه پیشین مرتبط با وزن تخم مرغ هم خوانی داشتند. در تفسیر مجموعه ژنی تعداد 28 مسیر هستی شناسی ژنی و بیوشیمیایی با صفات وزن تخم مرغ شناسایی شد (P˂ 0. 01). از این بین, مسیرهایRegulation of feeding behavior, Positive Regulation of apoptotic process, Positive regulation of protein phosphorylation osteoblast differentiation, Positive regulation of gluconeogenesis, Cell-cell junction وFocal adhesion عملکرد های مهمی را در ارتباط با وزن تخم مرغ و فرآیند تولید تخم مرغ از طریق رشد اووسیت و تخمک اندازی, تشکیل پروتیین آلبومین و تشکیل پوسته تخم مرغ بر عهده داشتند. نتیجه گیری: با توجه به تایید نتایج حاصل از مطالعه قبلی در زمینه پویش ژنومی صفات وزن تخم مرغ و شناسایی مناطق ژنومی جدید استفاده از یافته های این تحقیق می تواند در انتخاب ژنتیکی برنامه های اصلاح نژادی مرغ مفید باشد.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    جعفری منش، علیرضا، خلت آبادی فراهانی، امیرحسین، مرادی، محمدحسین، و محمدی، حسین. (1399). ژنی جهت شناسایی ژن ها و مسیرهای زیستی مرتبط با صفات تجزیه و تحلیل مجموعه های وزن تخم مرغ در کل دوره تولید. مجله بیوتکنولوژی کشاورزی، 12(3 )، 91-116. SID. https://sid.ir/paper/954992/fa

    Vancouver: کپی

    جعفری منش علیرضا، خلت آبادی فراهانی امیرحسین، مرادی محمدحسین، محمدی حسین. ژنی جهت شناسایی ژن ها و مسیرهای زیستی مرتبط با صفات تجزیه و تحلیل مجموعه های وزن تخم مرغ در کل دوره تولید. مجله بیوتکنولوژی کشاورزی[Internet]. 1399؛12(3 ):91-116. Available from: https://sid.ir/paper/954992/fa

    IEEE: کپی

    علیرضا جعفری منش، امیرحسین خلت آبادی فراهانی، محمدحسین مرادی، و حسین محمدی، “ژنی جهت شناسایی ژن ها و مسیرهای زیستی مرتبط با صفات تجزیه و تحلیل مجموعه های وزن تخم مرغ در کل دوره تولید،” مجله بیوتکنولوژی کشاورزی، vol. 12، no. 3 ، pp. 91–116، 1399، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/954992/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.
  • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button