استفاده از آفت کش های شیمیایی برای حفظ فرآورده های کشاورزی پس از گذشت چند دهه نه تنها از ارزش آن ها کاسته است بلکه امروزه این ترکیبات خود به مشکل جدی برای انسان و محیط زیست تبدیل شده اند. با این وجود استفاده از میکروارگانیزم ها یک راه حل کارا برای کنترل عوامل بیماری زای گیاهی است. در این پژوهش اثرات مهاری سویه های جنس Pseudomonas بر قارچ Rhizoctonia. solani عامل مرگ گیاهچه گوجه فرنگی بررسی گردید. عامل بیماری از گیاهچه های بیمار جداسازی گردید و بر اساس تست های تشخیصی گونه R. Solani تایید شد. از میان سویه های به دست آمده از ریزوسفر گوجه فرنگی های سالم در مزرعه با انجام تست های بیوشیمیایی 26 سویه به عنوان اعضا جنس Pseudomonas شناسایی و جداسازی گردید. اثبات بیماری زایی قارچ با آلوده کردن بذر گوجه فرنگی با قارچ و جداسازی قارچ از گیاه آلوده انجام شد. بررسی اثرات آنتاگونیستی سویه های Pseudomonas جدا شده بر قارچ R. solani در محیط PDA انجام گرفت. دو سویه S5 و 22 قادر به مهار رشد قارچ بوده و در اطراف کلنی آنها هاله عدم رشد قارچ مشاهده گردید. در دو محیط لوله آزمایش و گلدان نیز این دو سویه قادر به جلوگیری از رشد قارچ و ایجاد بیماری بودند. اثرات تحریک کنندگی رشد گیاه توسط باکتری های مذکور در گلدان بررسی گردید. دو سویه S5 و 22 به ترتیب موجب 1.31 و 1.34 برابر افزایش طول ساقه نسبت به گلدان های فاقد باکتری شدند. افزودن باکتری های S5 و 22 به ترتیب موجب 1.66 و 2.33 برابر افزایش وزن خشک گیاه نسبت به شاهد گردید. با توجه به توانایی مهار رشد قارچ و همچنین تاثیر مثبت بر رشد گیاه و بومی بودن برای خاک های ایران این دو سویه نامزدهای مناسبی برای استفاده به عنوان عوامل موثر در BioControl و PGPB می باشند.