تاکنون مطالعات سیتوژنتیکی پراکنده ای در خصوص سطح پلوئیدی و تعداد کروموزوم های تعدادی از جمعیتها و گونه های یونجه یکساله صورت گرفته ولی مطالعات قابل توجهی در زمینه چگونگی روابط و خویشاوندی احتمالی این گونه ها صورت نگرفته است. در این بررسی با استفاده از چندین روش آماری فاصله ژنتیکی گونه های مورد مطالعه ارزیابی می گردد. بدین منظور یازده جمعیت از هفت گونه مختلف یونجه یکساله مورد مطالعات کروموزومی قرار گرفتند. مشخصه های کاریوتیپی متعددی در حداقل پنج سلول متافازی از هر جمعیت مورد اندازه گیری و محاسبه قرار گرفت. با استفاده از آزمایش فاکتوریل در قالب طرح پایه کاملا تصادفی اختلاف بین جمعیتها و نیز کروموزومها مورد آزمون قرار گرفت. پس از تایید وجود تفاوت معنی دار بین جمعیتها و کروموزومها از نظر ابعاد کروموزومی اندازه گیری شده، با استفاده از روشهای آماری چند متغیره تجزیه خوشه ای و نیز تجزیه به مولفه های اصلی میزان قرابت بین جمعیتهای مورد مطالعه مورد ارزیابی قرار گرفت.دو گروه 14 و 16 کروموزومی در بین گونه ها و جمعیتهای مورد مطالعه مشاهده گردید. در جمعیتهای 14 کروموزومی با تجزیه خوشه ای بر مبنای طول بازوی کوتاه سه جمعیت از گونه M. polymorpha در کنار یکدیگر قرار گرفتند که حاکی از کارآیی این صفت کاریوتیپی و نوع تجزیه در تعیین قرابت گونه ها می باشد. در بین جمعیتهای 16 کروموزومی گونه های M. truncatula و M. radiate بیشترین فاصله را بر مبنای طول کل کروموزوم نسبت به یکدیگر نشان دادند.در تجزیه و مولفه های اصلی سه متغیر طول کل کروموزوم، طول بازوی بلند و نسبت طول بازوی بلند به طول بازوی کوتاه بیشترین نقش را در تشکیل مولفه اول داشتند. همچنین مولفه اول به تنهایی بیش از 98 درصد از واریانس موجود در داده ها را بیان نمود. نسبت بازوی بلند به بازوی کوتاه و طول بازوی کوتاه بیشترین نقش را در تشکیل مولفه دوم دارا بودند.