در پژوهش حاضر تنوع زیستی درشت بی مهرگان (ماکروبنتوزها) با استفاده از شاخص های زیستی در رودخانه دوهزار تنکابن در سال 1390 1389 در هفت ایستگاه و طی دوازده نوبت نمونه برداری با سوربر سطح 0.1 متر مربع در سه تکرار صورت گرفت. نمونه های جمع آوری شده توسط فرمالین %4 تثبیت و در آزمایشگاه جداسازی و شمارش گردید. در بررسی کفزیان، 60 خانواده متعلق به 18 راسته و هفت رده شناسایی شد. همزمان با نمونه برداری از فون بنتیک برخی از فاکتورهای فیزیکی شیمیایی نظیر دمای آب و هوا،pH ،DO (اکسیژن محلول)، BOD (خواست اکسیژن بیوشیمیایی) در ایستگاه ها اندازه گیری شد. نتایج تغییرات معنی داری را روی دما PH, BOD5 نشان داد (p<0.05) ولی تغییرات در اکسیژن محلول در طول مدت بررسی معنی دار نبود (P>0.05) داده های بنتیک بصورت سنجه های ساختار جمعیتی شامل غنای EPT، نسبت فراوانی EPT به خانواده Chironomidae و شاخص تنوع شانون محاسبه گردید. آنالیز واریانس یک طرفه گروه های کفزی در بین ماه ها و ایستگاه ها مورد بررسی قرارگرفت، نتایج آزمون آنالیز واریانس در بین ایستگاه ها تفاوت معنی داری را نشان داد (P<0.05). بطور کلی از ایستگاه شماره 1 تا ایستگاه شماره 7 از مقدار عددی این شاخص ها کاسته شد که نشان دهنده کاهش کیفت آب در طول رودخانه بوده است. بر اساس شاخص EPT بالاترین میانگین به ایستگاه 3 با میانگین امتیاز 70.66 و پایین ترین امتیاز در ایستگاه 7 با امتیاز 22.01 مشخص شد. بالاترین میزان شاخص EPT/Ch در ایستگاه1 با امتیاز 1.11 و پایین ترین امتیاز در ایستگاه 7 با 0.31 تعیین شد. شاخص تنوع شانون در ایستگاه ها، از بالا به پایین روند نزولی را نشان داد. بطوری که بیشترین مقدار آن در ایستگاه 2 با میانگین امتیاز 2.27 و پایین ترین امتیاز در ایستگاه 7 با امتیاز 1.7 مشخص شد. بطور کلی نتایج حاصله نشان از عدم آلودگی در نواحی بالادست رودخانه دوهزار تنکابن و آلودگی متوسط رودخانه در نواحی پایین دست در ماه های مختلف را داشت.