با توجه به وجود رابطه متقابل و تنگاتنگ بین ساختمان ها و محیط خارجی آنها، عواملی چون ساخت و بافت شهری، شکل، ارتفاع و اندازه بناها، جهت گیری خیابان ها و ساختمان ها، مصالح، سطح فضاهای باز و پوشش گیاهی اقلیم خرد شهری را تحت تاثیر قرار می دهند. به عبارتی، هر عنصر انسان ساخت شهری در بالا و اطراف خود، اقلیم مصنوعی خاصی پدید می آورد که همواره با آن در ارتباط متقابل قرار می گیرد. شکل شهر و اجزا و عناصر تشکیل دهنده آن علاوه بر این که می توانند بر کیفیت فضاهای شهری اثر بگذارند، کیفیت هوای شهر را نیز می توانند تغییر دهند، به نحوی که تمرکز یا پراکندگی عناصر آلوده کننده هوا که از مسائل عمده شهرهای امروز دنیا است و به جریان های جوی و تشکیل جزایر حرارتی در داخل شهر بستگی دارد، نیز به نوبه خود تحت تاثیر شکل شهر قرار می گیرد. مقاله حاضر با هدف بررسی نقش شکل شهری بر خرداقلیم و ایجاد آسایش حرارتی برای کاربران فضا، تدوین شده و با استفاده از روش توصیفی-تحلیلی در بخشی از اراضی 17.5 هکتاری سیلو شهر یزد انجام گرفته است. در مرحله اول با روش شبیه سازی با استفاده از نرم افزار انوی مت، پارامترهای اقلیمی چون دمای هوا، سرعت باد، میزان دمای متوسط تابشی، رطوبت نسبی در گرم ترین روز سال 1394 برای سایت محاسبه و سپس آسایش حرارتی بر اساس شاخص فانگر PMV برای گروه مشخص برآورد شد. در مرحله دوم 24 سناریوی پیشنهادی با توجه به نحوه ترکیب توده و فضا و جهت قرارگیری، شبیه سازی شد تا از طریق مقایسه آسایش حرارتی مناسب ترین شکل شهری از نظر هم جواری توده و فضا و چینش قطعات و جهت گیری برای شرایط آب و هوایی یزد شناسایی شود. نتایج نشان می دهد شکل شهری حیاط مرکزی با جهت گیری شمال غربی-جنوب شرقی مناسب ترین شکل شهری برای شهر یزد است و حداکثر شرایط آسایش حرارتی را برای عابران پیاده فراهم خواهد کرد.