زمینه و هدف: همه گیری کرونا در جهان همراه با ایجاد بحران در سیستم های بهداشتی درمانی بود. چنانچه مراقبت از بیماران مبتلا به کووید-19 با چالش هایی روبه رو شد. بنابراین مطالعه ای با هدف تبیین چالش های مراقبت های درمانی بیماران بستری در مرکز آموزشی درمانی فرقانی انجام شد. روش بررسی: این مطالعه با رویکرد تحلیل محتوای کیفی در سال 1399 انجام شد. به منظور دسترسی به اطلاعات غنی و جامع، مرکز آموزشی درمانی فرقانی به عنوان بستر پژوهش انتخاب شد. 11 بیمار کووید-19 با استفاده از روش مبتنی بر هدف انتخاب شدند. ابزار گردآوری داده ها مصاحبه عمیق نیمه ساختارمند بود. تحلیل داده ها با استفاده از روش تحلیل محتوای قراردادی انجام شد. یافته ها: این مطالعه نتایج حاصل از تحلیل مصاحبه را در قالب 3 طبقه اصلی شامل بیماری ناشناخته، منابع انسانی و تجهیزات و همچنین نگرانی های فردی، خانوادگی و اجتماعی استخراج شد. نتیجه گیری: بیماران به دلیل وضعیت ناشناخته بیماری، نداشتن تجربه و منابع کافی کادر درمان و همچنین نگرانی های فردی و خانوادگی با چالش های مختلفی مواجه شدند. بنابراین پیشنهاد می شود برای مدیریت و کنترل همه گیری ها در آینده برنامه ریزی مناسب صورت گیرد.