اندازه گیری فلورسانس کلروفیل روشی سریع و غیر تخریبی است که به عنوان شاخصی مهم برای شناسایی ارقام متحمل به تنش های محیطی ازجمله تنش یخ زدگی مورد استفاده قرار گرفته است. به منظور بررسی امکان استفاده از پارامترهای فلورسانس کلروفیل در ارزیابی تحمل اکوتیپ های چندساله چاودار به تنش یخ زدگی آزمایشی به صورت فاکتوریل بر پایه طرح کاملا تصادفی با سه تکرار در دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد اجرا شد. عامل های مورد مطالعه شامل 10 اکوتیپ چاودار (264، 941، 8425، 15771، 1587، 14947، 591، 1275، 3857 و 12640)، 9 دمای یخ زدگی (0، 3-، 6-، 9-، 12-، 15-، 18-، 21-و 24-درجه سانتی گراد) و چهار مرحله اندازه گیری حداکثر کارایی فتوسیستم II در دوره ی بازیابی گیاه پس از اعمال تنش یخ زدگی (12، 24، 48 و 96 ساعت) بودند. حداکثر کارایی فتوسیستم II در گیاهچه های چاودار مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که اکوتیپ های چاودار تا دمای 18-درجه سانتی گراد از نظر حداکثر کارایی فتوسیستم II تفاوت معنی داری نداشتند، اما در دماهای 21-و 24-درجه سانتی گراد و با گذشت زمان بازیابی از 12 به 24 ساعت حداکثر کارایی فتوسیستم II کاهش یافت. از نظر دمای کاهنده 50 درصد حداکثر کارایی فتوسیستم II بین اکوتیپ های چاودار تفاوت معنی داری وجود داشت، به طوری که در 12 ساعت بعد از اعمال تنش یخ زدگی اکوتیپ 12640 در دمای 8/24-درجه سانتی گراد به 50 درصد کاهش حداکثر کارایی فتوسیستم II خود رسید و اکوتیپ 264 و 941 نیز به ترتیب با 2/20-و20-درجه سانتی گراد بالاترین دمای کاهنده 50 درصد حداکثر کارایی فتوسیستم II را دارا بودند. بین حداکثر کارایی فتوسیستم II با درصد نشت الکترولیت ها و درصد بقا همبستگی معنی داری وجود داشت که نشان دهنده پتانسیل مناسب شاخص مذکور برای تشخیص سریع ارقام حساس و متحمل به تنش یخ زدگی در چاودار می باشد.