هدف از مطالعه حاضر ارزیابی کاربرد آنتروپی شانون در تعیین کیفیت آب های سطحی می باشد. به منظور تخصیص وزن به هر یک از پارامترهای کیفیت آب از روش آنتروپی شانون و وزن دهی های سازمان بهداشت جهانی استفاده شد. در این پژوهش داده های ماهانه کلسیم، منیزیم، بی کربنات، سدیم، سولفات، EC، pH وTDS از سال 1394-1347 برای رودخانه های کارون در ایستگاه های هیدرومتری اهواز، دارخوین، گتوند و ملاثانی و رودخانه بابلرود در ایستگاه های هیدرومتری قرآن تالار و کشتارگاه تجزیه و تحلیل شد. نتایج نشان داد که آنتروپی شانون می تواند به خوبی وزن دهی را انجام دهد و اختلاف جزئی بین وزن دهی آنتروپی شانون و وزن دهی های سازمان بهداشت جهانی وجود دارد. وزن دهی های حاصل از آنتروپی شانون و پارامترهای موثر در کیفیت آب در رودخانه کارون در ایستگاه های هیدرومتری اهواز pH=0. 15، دارخوین 0. 11=TDS، گتوند EC=0. 13 و ملاثانی pH=0. 15، همچنین در رودخانه بابلرود در ایستگاه هیدرومتری قرآن تالار و کشتارگاه وزن دهی ها برطبق آنتروپی شانون و پارامترهای موثر در کیفیت آب به ترتیب pH=0. 15 و TDS=0. 14 می باشد. مقادیر شاخص کیفیت آب در رودخانه کارون با توجه به شاخص WQI در بازه ی عالی و خوب و برای رودخانه بابلرود در وضعیت عالی می باشد.