زمینه: امروزه تهیه رادیوگرافی بر اساس موقعیت طبیعی سر (NHP)توصیه می شود و معیار های سفالومتریک طبیعی هر جامعه مختص خود آن است. یکی از روش های سریع و دقیق تحلیل سفالومتریک، استفاده از نرم افزارهاست.هدف: مطالعه به منظور طراحی برنامه رایانه ای تحلیل مش دیاگرام و تهیه معیارهای طبیعی نوجوانان ایرانی در دو شهر مشهد و قزوین انجام شد.مواد و روش ها: دراین مطالعه برنامه تحلیل مش با استفاده از نرم افزارVisual C++ و تحت Windows XP با استفاده از بانک اطلاعاتی My-SQL طراحی شد. سپس 37 سفالومتری از افراد دارای اکلوژن طبیعی شهر قزوین (21 دختر و 16 پسر) و 65 سفالومتری از افراد دارای اکلوژن طبیعی شهر مشهد (32 دختر و 33 پسر) که بین سنین 11 تا 13 سال قرار داشتند و به روشNHP انتخاب شده بودند، اسکن شده و وارد نرم افزار شدند. نمودار مش بنا به تعریف موریس برای هر نمونه ترسیم شد. با استفاده از میانگین نقاط، 4 مش طبیعی به تفکیک جنسی در هر شهر ترسیم و انحراف معیار میانگین ها به صورت بیضی نشان داده شد. با استفاده از آزمون تی به تفکیک جنس، مشخصات عمودی و افقی 34 معیار در دو شهر مقایسه شدند.یافته ها: در 38 اندازه از مجموع 68 اندازه، شامل 17 عرض و 21 ارتفاع در بین دختران دو شهر اختلاف معنی دار آماری مشاهده شد .(p<0.05)در 20 اندازه از مجموع 68 اندازه، شامل 8 عرض و 12 ارتفاع در پسران دو شهر اختلاف معنی دار آماری مشاهده شد.(p<0.05) نتیجه گیری: علاوه بر جنس، سن، اندازه طول قاعده قدامی جمجمه(Sella-Nasion, SN) و ارتفاع ناحیه فوقانی قدامی صورت (Nasion-Anterior Nasal Spine, N-ANS)، باید قومیت بیمار نیز جهت ارزیابی ناهنجاری دندانی - فکی مورد توجه قرار گیرد.